[发明专利]一种RNA的一步裂解一管法RT-PCR检测方法有效
申请号: | 201310205275.4 | 申请日: | 2013-05-28 |
公开(公告)号: | CN103333955A | 公开(公告)日: | 2013-10-02 |
发明(设计)人: | 陈燃;金晓铮 | 申请(专利权)人: | 浙江今复康生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 杭州天正专利事务所有限公司 33201 | 代理人: | 黄美娟;冷红梅 |
地址: | 310052 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rna 一步 裂解 一管法 rt pcr 检测 方法 | ||
1.一种RNA的一步裂解一管法RT-PCR检测方法,所述方法包括:
(1)设计与目标RNA上任意一段序列互补的长度为25~40mer的单链寡核苷酸DNA,记为引物A;该引物的GC含量为40~60%,解链温度为70~85℃;或者,若目标RNA为带poly(A)末端的mRNA,则引物A选用长度为29~50mer的Oligo(dT);将引物A固定在PCR管内,得到固定PCR管;
(2)取待测样本,加入添加有表面活性剂和RNA酶抑制剂的裂解液,反复吸打,转移至离心管中,冰上放置20min,4℃离心,取上清液,得到裂解上清液;
(3)取裂解上清液20uL至固定PCR管中,50~60℃保温10~30min,吸干管内液体,以洗涤液洗涤1次,吸干,加入20uL由RT酶、dNTP和RT缓冲液配制的RT反应液,42℃保温0.5~1小时;
(4)吸干管内液体,加入20uL由耐热DNA聚合酶、dNTP、PCR缓冲液和PCR引物配制的PCR反应液,进行PCR扩增,扩增产物进行荧光定量分析或琼脂糖凝胶电泳分析;
(5)以空白裂解液作为阴性对照,按照步骤(1)~(4)的方法进行处理和分析,以样本Ct值小于空白裂解液Ct值判断为阳性。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于步骤(2)中所述裂解液组成如下:4.0mol/L异硫氰酸胍,350mmol/L NaCl,1%Triton X-100,10mmol/L2-巯基乙醇,0.1mg/ml鱼精DNA,溶剂为10mmol/L、pH7.5的Tris-HCl。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于步骤(3)所述RT反应液组成如下:75mmol/LKCl,3mmol/L MgCl2,10mmol/L DTT,0.5mmol/L dNTP,5U/20ul MMLV RT酶,溶剂为50mM、pH8.3的Tris-HCl。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于步骤(4)中所述PCR反应液组成如下:50mmol/L KCl,1.5mmol/L MgCl2,0.2mmol/L dNTP,0.05%Tween20,0.4×SYBR Green I,0.5U/20ul Taq酶,0.2umol/L PCR引物,溶剂为10mmol/L、pH9.0的Tris-HCl。
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