[发明专利]一种借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物及应用无效

专利信息
申请号: 201310211826.8 申请日: 2013-05-29
公开(公告)号: CN103290144A 公开(公告)日: 2013-09-11
发明(设计)人: 吴斌;葛以跃;祁贤;崔仑标;朱叶飞;汤奋扬;史智扬;周明浩 申请(专利权)人: 江苏省疾病预防控制中心
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 南京苏科专利代理有限责任公司 32102 代理人: 何朝旭
地址: 210009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 借助 rt lamp 检测 感染 h7n9 禽流感 病毒 引物 应用
【权利要求书】:

1.一种借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物,包括简并引物和环引物,所述简并引物和环引物是依据现有核酸数据库中人感染H7N9亚型禽流感病毒的H7基因节段序列和N9基因节段序列分别进行同源性比对,根据保守序列,针对各基因设计而得,所述H7基因简并引物的序列为:

H7-F3TGTCTGTTATCCTGGGAAAT

H7-B3AGCATTATCTGTGTTTGACAG

H7-FIP GTATGTGAATCCCATTGCTTCCTTGGTGAATGAAGAAGCTCTGAGG

H7-BIP GGAATAAGAACTAATGGARCAACCAAGCCATTTCATTTCTGCATAG;所述H7基因环引物的序列为:

H7-LF CCGCCTGATTCTCTGAGWATTT

H7-LB GCATGTAGGAGATCAGGATCTTCA;

所述N9基因简并引物的序列为:

N9-F3CGAGGTCTGGATACGAGA

N9-B3TTATCYTCCTTGGGTCTTCC

N9-FIP AGCGTTTARTACAATTGTCTGACCTTTAAAAGTGCCAAATGCATTGA

N9-BIP CTGGAGTGGTTACAGTGGATCTYTCCACATAAAAACACGCTC;

所述N9基因环引物的序列为:

N9-LF TGAATGGGCTTTGATCTATCATCTG

N9-LB TGGACTATTGGGCTGARGGGGAC。

2.根据权利要求1所述借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物的应用,包括以下步骤:

步骤一:针对人感染H7N9亚型禽流感病毒的H7基因节段和N9基因节段序列,设计并合成包含T7启动子的引物,对扩增的目的基因片段进行体外转录,转录产物纯化和定量后,将其稀释为106-100拷贝/μl,即得人感染H7N9亚型禽流感病毒的H7基因节段和N9基因节段的标准RNA模板,作为对照;

步骤二:将人感染H7N9亚型禽流感病毒的HA和NA基因分别进行H7亚型RT-LAMP反应和N9亚型RT-LAMP反应,在所述RT-LAMP反应体系中加入目测荧光染料,于反应结束后依据目测结果进行结果判读。

3.根据权利要求2所述借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物的应用,其特征在于:所述步骤一中,

H7基因T7启动子引物的序列为:

HA:CCTGGTATTCGCTCTGATTGC

HA-T7:ACTCGTTAATACGACTCACTATAGGGAGGCACCGCATGTTTCCATTCT;N9基因T7启动子引物的序列为:

NA:TCTATGCACTTCAGCCACTG

NA-T7:ACTCGTTAATACGACTCACTATAGGGAGCCATCAGGCCAGTTCCATTG。

4.根据权利要求2所述借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物的应用,其特征在于:所述H7亚型和N9亚型的RT-LAMP反应条件均为60~65℃,30~60min。

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