[发明专利]一种借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物及应用无效
申请号: | 201310211826.8 | 申请日: | 2013-05-29 |
公开(公告)号: | CN103290144A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 吴斌;葛以跃;祁贤;崔仑标;朱叶飞;汤奋扬;史智扬;周明浩 | 申请(专利权)人: | 江苏省疾病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 南京苏科专利代理有限责任公司 32102 | 代理人: | 何朝旭 |
地址: | 210009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 借助 rt lamp 检测 感染 h7n9 禽流感 病毒 引物 应用 | ||
1.一种借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物,包括简并引物和环引物,所述简并引物和环引物是依据现有核酸数据库中人感染H7N9亚型禽流感病毒的H7基因节段序列和N9基因节段序列分别进行同源性比对,根据保守序列,针对各基因设计而得,所述H7基因简并引物的序列为:
H7-F3TGTCTGTTATCCTGGGAAAT
H7-B3AGCATTATCTGTGTTTGACAG
H7-FIP GTATGTGAATCCCATTGCTTCCTTGGTGAATGAAGAAGCTCTGAGG
H7-BIP GGAATAAGAACTAATGGARCAACCAAGCCATTTCATTTCTGCATAG;所述H7基因环引物的序列为:
H7-LF CCGCCTGATTCTCTGAGWATTT
H7-LB GCATGTAGGAGATCAGGATCTTCA;
所述N9基因简并引物的序列为:
N9-F3CGAGGTCTGGATACGAGA
N9-B3TTATCYTCCTTGGGTCTTCC
N9-FIP AGCGTTTARTACAATTGTCTGACCTTTAAAAGTGCCAAATGCATTGA
N9-BIP CTGGAGTGGTTACAGTGGATCTYTCCACATAAAAACACGCTC;
所述N9基因环引物的序列为:
N9-LF TGAATGGGCTTTGATCTATCATCTG
N9-LB TGGACTATTGGGCTGARGGGGAC。
2.根据权利要求1所述借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物的应用,包括以下步骤:
步骤一:针对人感染H7N9亚型禽流感病毒的H7基因节段和N9基因节段序列,设计并合成包含T7启动子的引物,对扩增的目的基因片段进行体外转录,转录产物纯化和定量后,将其稀释为106-100拷贝/μl,即得人感染H7N9亚型禽流感病毒的H7基因节段和N9基因节段的标准RNA模板,作为对照;
步骤二:将人感染H7N9亚型禽流感病毒的HA和NA基因分别进行H7亚型RT-LAMP反应和N9亚型RT-LAMP反应,在所述RT-LAMP反应体系中加入目测荧光染料,于反应结束后依据目测结果进行结果判读。
3.根据权利要求2所述借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物的应用,其特征在于:所述步骤一中,
H7基因T7启动子引物的序列为:
HA:CCTGGTATTCGCTCTGATTGC
HA-T7:ACTCGTTAATACGACTCACTATAGGGAGGCACCGCATGTTTCCATTCT;N9基因T7启动子引物的序列为:
NA:TCTATGCACTTCAGCCACTG
NA-T7:ACTCGTTAATACGACTCACTATAGGGAGCCATCAGGCCAGTTCCATTG。
4.根据权利要求2所述借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物的应用,其特征在于:所述H7亚型和N9亚型的RT-LAMP反应条件均为60~65℃,30~60min。
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