[发明专利]用于胃癌的诊断和预后的表观遗传生物标志物ADAMTS9

权利要求书

1.用于检测个体中胃癌的试剂盒，包括：(1)能提供平均量的ADAMTS9蛋白或ADAMTS9mRNA的标准对照；和(2)能特异性地和定量地鉴定ADAMTS9蛋白或ADAMTS9mRNA的试剂。

2.权利要求1的试剂盒，其中所述试剂包括能特异性地结合ADAMTS9蛋白(SEQ ID NO:5)的抗体。

3.权利要求1的试剂盒，其中所述试剂包括能与ADAMTS9mRNA(SEQ ID NO:3)杂交的多核苷酸探针。

4.权利要求3的试剂盒，其中所述多核苷酸探针具有SEQ ID NO:2、3或4所示核苷酸序列或者其互补序列的至少一个区段。

5.权利要求1-4中任一项的试剂盒，其中所述试剂包含可检测部分。

6.权利要求1的试剂盒，其中所述试剂包括用于在扩增反应中特异性地扩增SEQ ID NO:2或其互补序列的至少一个区段的寡核苷酸引物对。

7.权利要求6的试剂盒，其中所述寡核苷酸引物对包含SEQ ID NO:8和9所示核苷酸序列。

8.权利要求1的试剂盒，还包含操作说明。

9.权利要求1的试剂盒，还包括用于处理获自所述个体的样品从而分离蛋白或mRNA的试剂。

10.权利要求9的试剂盒，其中所述样品是胃组织样品，优选胃粘膜样品。

11.权利要求1的试剂盒，用于在不同时间点进行多次检测。

12.用于检测个体中胃癌的试剂盒，包括：

(1)能差异性地修饰甲基化的和非甲基化的DNA的试剂；和

(2)指示剂，在用所述试剂处理来自所述个体的样品之后，所述指示剂能确定含有CpG的基因组序列中的至少一个CpG是甲基化的还是非甲基化的，其中所述含有CpG的基因组序列是SEQ ID NO:1、6或7的至少一个区段，并且包含至少一个CpG。

13.权利要求12的试剂盒，其中所述含有CpG的基因组序列包含两个或者更多个CpG，并且其中全部CpG中至少50%是甲基化的表明所述个体患有胃癌。

14.权利要求12或13的试剂盒，其中所述含有CpG的基因组序列是SEQ ID NO:1、6或7的至少15个连续核苷酸的区段、或至少20个连续核苷酸的区段、或至少50个连续核苷酸的区段或全长序列。

15.权利要求12的试剂盒，其中所述含有CpG的基因组序列是SEQ ID NO:1，并且其中全部CpG中至少有2个是甲基化的表明所述个体患有胃癌。

16.权利要求12的试剂盒，其中所述含有CpG的基因组序列是SEQ ID NO:1，并且其中全部CpG中至少有13个是甲基化的表明所述个体患有胃癌。

17.权利要求12的试剂盒，还包括用于处理获自所述个体的样品从而分离基因组DNA的试剂。

18.权利要求17的试剂盒，其中所述样品是胃组织样品，优选胃粘膜样品。

19.权利要求18的试剂盒，其中所述胃组织样品是胃肿瘤样品。

20.权利要求12的试剂盒，用于在不同时间点进行多次检测。

21.权利要求12的试剂盒，其中所述能差异性地修饰甲基化的DNA和非甲基化的DNA的试剂是能优先切割甲基化的DNA的酶、能优先切割非甲基化的DNA的酶或者亚硫酸氢盐，例如亚硫酸氢钠。

22.权利要求21的试剂盒，其中所述能差异性地修饰甲基化DNA和非甲基化DNA的试剂是亚硫酸氢盐，所述指示剂包括能特异性地扩增含CpG的基因组序列的第一寡核苷酸引物对，所述基因组序列中的甲基化的C在亚硫酸氢盐处理之后保持不变；并且所述指示剂任选地包括能特异性地扩增含CpG的基因组序列的第二寡核苷酸引物对，所述含CpG的基因组序列中的非甲基化的C由于亚硫酸氢盐处理而改变为U。

23.权利要求22的试剂盒，其中第一寡核苷酸引物对具有SEQ ID NO:12和13所示核苷酸序列，第二寡核苷酸引物对具有SEQ ID NO:14和15所示核苷酸序列。