[发明专利]一种基于全基因组序列分析不产真菌毒素的真菌菌株安全性评价方法

权利要求书

1.一种基于全基因组序列分析不产真菌毒素的真菌菌株安全性评价方法，其特征在于该方法包括以下步骤：

（1）基于真菌全基因组序列数据进行基因预测与注释；

通过Augustus软件与Genemark软件工具分别对测序后全基因组序列数据进行基因预测与编码区分析，将预测基因序列与各数据库NR、PFAM、CDD、KEGG、COG、SwissProt及TrEMBL进行比对，获得相应的功能注释信息；

（2）针对各种真菌毒素合成代谢骨架途径和特异途径及相关基因进行全基因组比对：

所述针对的真菌毒素为：根霉素、黄曲霉毒素、杂色曲霉素、伏马毒素、桔霉素、根瘤菌素、环匹阿尼酸、单端孢霉烯族毒素这些已报道的真菌毒素；

所述合成代谢骨架途径和特异途径为：包括聚酮合酶polyketide sythnase的PKS途径、非核糖体多肽合成酶non-ribosomal peptide synthetase的NRPS途径、PKS-NRPS混合代谢、萜类化合物代谢，上述的单个或多个共同作用途径进行全基因组比对分析；

（3）分析该真菌菌株是否具有产真菌毒素的完整的代谢途径和关键基因，评价其产真菌毒素的潜在能力，进而评价该真菌在食品工业应用中发酵产品和微生物菌种的安全性。

2.权利要求1所述基于全基因组序列分析不产真菌毒素的真菌菌株安全性评价方法的应用，其特征在于基于全基因组序列数据，对于是否产真菌毒素的未知真菌微生物安全性进行评价，基于已报道的华根霉（Rhizopus chinensis）CCTCC M 201021、米曲霉（Aspergillus oryzae）RIB326真菌基因组数据，分析结果表明，华根霉和米曲霉菌株基本不具备产目前已知的真菌毒素的关键基因或合成能力，菌种及其发酵产品是相对安全的；而其他曲霉菌株中存在着部分毒素合成关键基因簇，菌株的安全性存在风险；由于菌株的多样性，存在着真菌毒素产生菌与非产生菌。