[发明专利]杂交鳢弹状病毒荧光定量PCR检测试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201310302713.9 | 申请日: | 2013-07-18 |
公开(公告)号: | CN103397106A | 公开(公告)日: | 2013-11-20 |
发明(设计)人: | 刘春;曾伟伟;李凯彬;王庆;王芳;常藕琴;梁慧丽;梁惜梅;吴淑勤 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 谭英强 |
地址: | 510380 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 杂交 弹状病毒 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.杂交鳢弹状病毒荧光定量PCR检测试剂盒,包括以下组份:(1)荧光定量PCR引物HSHRV-2F、HSHRV-2R和探针HSHRV-2 probe;(2)荧光定量PCR反应液;(3)阳性对照;(4)阴性对照;其中,所述荧光定量PCR引物和探针的核苷酸序列如下:
HSHRV-2F:5'-CACCAGTCATATCAATCC-3' (SEQ ID NO.3);
HSHRV-2R:5'-CGGACTTAAACCTCATTC-3' (SEQ ID NO.4);
HSHRV-2 probe:5'-ACCTCTCCGCACATTGACATCT-3' (SEQ ID NO.5)。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述阳性对照,其制备方法包括以下步骤:提取杂交鳢弹状病毒总RNA,反转录获得cDNA,然后以cDNA为模板,以P1、P2为引物,进行PCR扩增,将回收纯化的扩增产物作为阳性对照;其中,引物P1的核苷酸序列为5'-CGCGGATCCATCATGAAATCAATCATTGCACT-3'(SEQ ID NO.1),引物P2的核苷酸序列为5'-CATCTGCAGAATTGATACTGCTGCAAAGGG-3'(SEQ ID NO.2)。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:将扩增产物连接到pMD18-T载体,以阳性克隆的重组质粒作为阳性对照。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述荧光定量PCR反应液含有Premix Ex TaqTM,ROX Reference Dye Ⅱ。
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述阴性对照为ddH2O。
6.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述探针的5'端标记荧光染料FAM,3'端标记淬灭基团BHQ。
7.杂交鳢弹状病毒的检测方法,包括以下步骤:
1)提取待检样本的总RNA,反转录获得cDNA;
2)以cDNA为模板,用杂交鳢弹状病毒荧光定量PCR检测试剂盒进行特异性RT-PCR扩增;
3)反应结束,根据待检样本的Ct值判断其为杂交鳢弹状病毒阳性或阴性;
其中,杂交鳢弹状病毒荧光定量PCR检测试剂盒如权利要求1~6任意一项所述。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)的扩增反应体系为:10μL的Premix Ex TaqTM;0.4μL的50×ROX Reference Dye Ⅱ;0.3μmol/L的引物HSHRV-2F;0.3μmol/L的引物HSHRV-2R;0.24μmol/L的探针HSHRV-2 probe;2μL的cDNA模板;加ddH2O补足体积至20μL。
9.根据权利要求7或8所述的方法,其特征在于:所述步骤2)的扩增反应程序为:94℃ 2min; 94℃ 15s,55℃15 s,72℃ 20s,5个循环;94℃ 5s,55℃ 35s ,40个循环。
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