[发明专利]一种DNA片段的回收方法有效

专利信息
申请号: 201310313712.4 申请日: 2013-07-24
公开(公告)号: CN103343121A 公开(公告)日: 2013-10-09
发明(设计)人: 田生礼;梁秀怡;梁志成 申请(专利权)人: 深圳大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 深圳市恒申知识产权事务所(普通合伙) 44312 代理人: 陈健
地址: 518060 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 片段 回收 方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种DNA片段的回收方法,采用所述回收方法能从琼脂糖凝胶中同步回收琼脂糖和DNA片段。

背景技术

琼脂糖由D-半乳糖与3,6-内醚-半乳糖作为结构单元交替组成,是一种呈中性的直链多糖。其具有亲水性,并且几乎完全不含有带电基团,对敏感的生物大分子很少引起变性和吸附,在生物类应用上是理想的惰性载体。琼脂糖在水中一般加热到90℃以上溶解,一定浓度的琼脂糖水溶液在温度下降到35-40℃时能形成性能良好的半固体状的凝胶,由于利用琼脂糖进行凝胶电泳操作快速,简单,电泳作用低,因此广泛应用于分离和回收DNA片段,极大地促进了重组DNA技术的发展。目前已报道多种从凝胶中回收DNA片段的方法,CsCl密度梯度离心法,蔗糖密度梯度离心法在早期使用较多,但由于价格高、耗时等原因被其他方法代替;Dretzen发明DEAE—纤维素滤膜回收法,DNA得率高,但存在操作繁琐,DNA片段洗脱困难等问题;而低熔点琼脂糖法的试剂成本较高;利用冻融法和超声波破胶法回收的DNA纯度好,但回收率较低;虽然透析袋电洗脱法回收率高,也由于回收耗时过长而未能广泛使用;另外还有试剂盒法,玻璃奶法,琼脂糖酶法,挖孔法等,其各有利弊。

现有的DNA回收方法存在许多不足之处,如DNA回收效率低、耗费时间长、操作复杂、试剂成本过高,需要自制电泳洗脱装置,还有回收产物不纯等问题,给下游实验操作带来诸多不便,而这些问题至今仍没有被比较好地解决。另外,以上各种方法均不能兼顾琼脂糖的回收和利用,浪费昂贵的琼脂糖的同时不利于低碳环保。目前,对于在琼脂糖凝胶中同步回收琼脂糖和DNA片段的研究至今未见报道。

因此,现有技术还有待于改进和发展。

发明内容

鉴于上述现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种DNA片段的回收方法,该方法可从琼脂糖凝胶中高效同步回收DNA和琼脂糖,具有廉价实用、低碳环保、快速简便、结果稳定可靠、设备要求简单等特点,旨在解决现有的DNA回收方法不能兼顾琼脂糖的回收和利用的问题,且还解决了现有技术中存在许多不足之处,如DNA回收效率低、耗费时间长、操作复杂、试剂成本过高、回收产物不纯等问题。

本发明的技术方案如下:

一种DNA片段的回收方法,其中,包括以下步骤:

A、在含有DNA的琼脂糖凝胶条中加入溶胶液,混匀,加热至琼脂糖凝胶条融化;

B、将融化后的溶液静置冷却,加入预冷的异丙醇,混匀,再次静置,琼脂糖析出形成沉淀;

C、分离得到琼脂糖沉淀和含有DNA片段的上清液;

D、分别回收DNA片段和琼脂糖;

步骤A中,所述溶胶夜为弱碱性的异硫氰酸胍溶液(PH值为8.0)。

所述的DNA片段的回收方法,其中,步骤C后,还包括以下步骤:

在琼脂糖沉淀中加入TE缓冲液洗涤琼脂糖沉淀,溶解残存在琼脂糖沉淀中的少量DNA片段,离心,取上清液与步骤C中的上清液合并。

所述的DNA片段的回收方法,其中,步骤A中,所述加热的过程为65-75℃水浴加热至琼脂糖凝胶完全融化;所述溶胶液为用TE缓冲液(PH值为8.0)溶解异硫氰酸胍制成,其浓度为0.25-0.40mol/L;所述溶胶液的用量为与所述含有DNA琼脂糖凝胶条等体积,或根据DNA片段的含量和琼脂糖凝胶条的浓度,适当调整所述溶胶液的用量;

步骤B中,所述静置冷却过程为置于冰上静置;所述预冷的异丙醇,其预冷温度为-20℃;所述再次静置过程为在冰上静置冷却。

所述的DNA片段的回收方法,其中,所述回收DNA片段过程包括以下步骤:

a1、在上清液中加入依次异丙醇和醋酸钠(PH值为5.2,浓度为3mol/L)溶液,置于低温-18℃至-30℃,沉淀DNA片段;

b1、用乙醇溶液洗涤DNA片段沉淀;

c1、晾干后加入TE缓冲液溶解得到回收的DNA。

所述的DNA片段的回收方法,其中,在进行回收DNA片段的步骤a1之前,若回收的DNA片段含有较多有机污染物或蛋白质,则需加步骤C所得的上清液用同样体积的酚/氯仿、氯仿分别抽提一次,取上清液。

所述的DNA片段的回收方法,其中,步骤c1中,若加入TE缓冲液后有沉淀出现,则将沉淀吹打均匀,使DNA片段充分溶解在TE缓冲液中,离心分离,吸取上清液,得到含有DNA片段的上清液。

所述的DNA片段的回收方法,其中,所述步骤c1中,异丙醇的用量为待加入溶液同等体积;所述醋酸钠溶液的用量为总体积的1/10体积。

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