[发明专利]艰难梭菌毒素基因多重荧光PCR检测试剂盒及检测方法有效

专利信息
申请号: 201310316848.0 申请日: 2013-07-24
公开(公告)号: CN103361434A 公开(公告)日: 2013-10-23
发明(设计)人: 金大智;罗芸;王贤军;张严峻;叶菊莲 申请(专利权)人: 浙江省疾病预防控制中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12R1/145
代理公司: 杭州天正专利事务所有限公司 33201 代理人: 黄美娟;冷红梅
地址: 310051 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 艰难 毒素 基因 多重 荧光 pcr 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种艰难梭菌毒素基因多重荧光PCR检测试剂盒,主要包括特异性引物和探针以及PCR反应试剂,所述特异性引物和探针由艰难梭菌毒素A(tcdA)、毒素B(tcdB)、二元毒素A(cdtA)和二元毒素B(cdtB)的特异性引物和探针组成,其特征在于所述特异性引物和探针序列如下:

tcdA上游引物:5′-TCAGGAGTTGTTAAATCGTGGAAA-3′;

tcdA下游引物:5′-CAGAGTGAATACCTGGAAGCATATCA-3′;

tcdA荧光探针:5′-FAM-CTGCAGCATCTGACATAG-BHQ1-3′;

tcdB上游引物:5′-GATAATATTTACGGACAAGCAGTTGACT-3′;

tcdB下游引物:5′-AGTCTCAATTGTATAGGTTTCTCCAAAA-3′;

tcdB荧光探针:5′-VIC-AGCGGTTTAGTTAGAGTTG-BHQ1-3′;

cdtA上游引物:5′-TGGGAAGCACTATATTAAAGCAGA-3′;

cdtA下游引物:5′-ACATCAGCAAGTTCATTAGGTGTT-3′;

cdtA荧光探针:

5′-ROX-TTTGCTTTACCCCAAGARTCCCCCT-BHQ2-3′;

cdtB上游引物:5′-ATTTCTTTGACCCAAAGTTGATG-3′;

cdtB下游引物:5′-CCCACTTAACTGCAATTAAGTCC-3′;

cdtB荧光探针:

5′-CY5-TGATTGGGAAGACGAAGATTTGGAT-BHQ2-3′;

其中FAM、VIC、ROX和CY5为不同波长的荧光报告基团,BHQ1和BHQ2为荧光淬灭基团。

2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于所述试剂盒中还包括艰难梭菌毒素A(tcdA)、毒素B(tcdB)、二元毒素A(cdtA)和二元毒素B(cdtB)的标准品,所述标准品序列如下:

tcdA标准品:

tcaggagttgttaaatcgtggaaatttagctgcagcatctgacatagtaagattattagccctaaaaaattttgg

cggagtatatttagatgttgatatgcttccaggtattcactctg;

tcdB标准品:

gataatatttacggacaagcagttgactatagcggtttagttagagtggtgaagatatatattattttggagaaa

cctatacaattgagact;

cdtA标准品:

tgggaagcactatattaaagcagaagcatctgttgtaagtagtcttgattttaaagatgatgtaagtaaggggg

attcttggggtaaagcaaattataatgattggagtaataaattaacacctaatgaacttgctgatgt;

cdtB标准品:

atttctttgacccaaagttgatgtctgattgggaagacgaagatttggatacagataatgataatataccagatt

catatgaacgaaatggatatactattaaggacttaattgcagttaagtggg。

3.利用权利要求1所述试剂盒检测艰难梭菌毒素基因的方法,所述方法包括:

(1)提取待测样品DNA;

(2)以待测样品DNA为模板,加入艰难梭菌毒素A(tcdA)、毒素B(tcdB)、二元毒素A(cdtA)和二元毒素B(cdtB)的特异性引物和探针,PCR缓冲液,脱氧三磷酸核苷混合物和DNA聚合酶配制PCR反应液,进行PCR扩增,以非靶细菌为阴性对照于相同条件下进行PCR扩增;

(3)PCR扩增产物进行荧光检测,以阈值线刚好超过正常阴性对照的最高点设定阈值线,若待测样品荧光增长曲线超过阈值线,并呈良好的对数增长,则判断为阳性。

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