[发明专利]一种PCR快速检测大丽轮枝菌的方法及其试剂盒有效
申请号: | 201310321266.1 | 申请日: | 2013-07-29 |
公开(公告)号: | CN103333969A | 公开(公告)日: | 2013-10-02 |
发明(设计)人: | 李园;曹坳程;郭美霞;王秋霞;欧阳灿彬;颜冬冬;毛连纲;马涛涛 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/06;G01N21/64 |
代理公司: | 北京兆君联合知识产权代理事务所(普通合伙) 11333 | 代理人: | 胡敬红 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 pcr 快速 检测 大丽轮枝菌 方法 及其 试剂盒 | ||
1.一种PCR快速检测大丽轮枝菌的方法,以大丽轮枝菌DNA为模板进行PCR反应,其特征在于,所述PCR反应体系中加入有一对特异性引物dali1/dali2,该特异性引物的序列分别为:
特异性引物dali1:5’-CCGCCGGTCCATCAGTCTCTCTG-3’,
特异性引物dali2:5’-GCTTGTAGGGGGTTTAGAGGCAAGC-3’。
2.根据权利要求1所述的方法,所述PCR反应体系为:l0×PCR buffer2μL,15mM MgCl2 0.5μL,2.5mM dNTPs1.6μL,5μM引物dali1/dali2各0.5μL,浓度为5U/μL的Taq酶0.2μL,DNA模板2μL,,灭菌双蒸水12.7μL,终体积为20μL;PCR扩增程序为:94℃预变性3min;94℃变性1min,63℃退火1min,72℃延伸1min,共30个循环;最后72℃延伸10min。
3.根据权利要求1所述的方法,所述PCT快速检测为实时荧光定量PCR检测。
4.根据权利要求3所述的方法,所述PCR反应体系中加入有荧光基团SYBR Green Supermix。
5.根据权利要求4所述的方法,所述PCR体系总体积为20μL,SYBR Green Supermix 10μL,1μL浓度为10μM/L的特异性引物dali1,1μL浓度为10μM/L的特异性引物dali2,DNA模板2μL,余量为无菌双蒸水6μL,检测程序为:
第1步:95.0℃运行3分钟,
第2步:95.0℃运行10秒钟,
第3步:57.0℃运行30秒钟,
第4步:运行第2步,重复39次,
第5步:熔解曲线温度65.0℃至95.0℃,每5秒钟增加0.5℃。
6.根据权利要求1所述的方法,所述大丽轮枝菌DNA来自植物组织或土壤。
7.一种检测大丽轮枝菌的试剂盒,包括一PCR反应体系,所述PCR反应体系中含有特异性引物dali1/dali2:
特异性引物dali1:5’-CCGCCGGTCCATCAGTCTCTCTG-3’,
特异性引物dali2:5’-GCTTGTAGGGGGTTTAGAGGCAAGC-3’。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,所述PCR反应体系还包括荧光基团SYBR Green Supermix。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,所述PCR反应体系为:SYBR Green Supermix10μL,1μL浓度为10μM/L的特异性引物dali1,1μL浓度为10μM/L的特异性引物dali2,无菌双蒸水6μL;需加入的待测大丽轮枝菌DNA模板2μL。
10.根据权利要求1所述的试剂盒,还包括标准阳性模板,所述标准阳性模板为大丽轮枝菌菌株DNA经特异性引物dali1/dali2扩增,扩增产物与pGEMT-T Easy载体连接后获得的标准质粒DNA。
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