[发明专利]核酸和检测转基因水稻EB7001S及其衍生系的方法以及试剂盒及其用途在审
申请号: | 201310362525.5 | 申请日: | 2013-08-19 |
公开(公告)号: | CN104419708A | 公开(公告)日: | 2015-03-18 |
发明(设计)人: | 肖国樱;魏岁军;邓力华 | 申请(专利权)人: | 中国科学院亚热带农业生态研究所 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人: | 李婉婉;王崇 |
地址: | 410125*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核酸 检测 转基因 水稻 eb7001s 及其 衍生 方法 以及 试剂盒 用途 | ||
1.一种核酸,该核酸为转基因水稻EB7001S的旁侧序列的核酸,所述转基因水稻EB7001S的旁侧序列为SEQ ID No.1或SEQ ID No.1的片段,SEQ ID No.6或SEQ ID No.6的片段;其中,SEQ ID No.1的片段至少包括SEQ ID No.1的第149-190位的序列,优选至少包括SEQ ID No.1的第139-200位的序列,更优选至少包括SEQ ID No.1的第129-210位的序列;SEQ ID No.6的片段至少包括SEQ ID No.6的第1889-1930位的序列,优选至少包括SEQ ID No.6的第1879-1940位的序列,更优选至少包括SEQ ID No.6的第1869-1950位的序列。
2.一种检测转基因水稻的方法,该转基因水稻为转基因水稻EB7001S或者含有权利要求1所述的核酸的转基因水稻EB7001S的衍生水稻,该方法包括:
(1)使用针对权利要求1所述的核酸的特异性引物对,对取自待测水稻的核酸样品进行PCR扩增,得到PCR扩增后的产物;
(2)检验所述PCR扩增后的产物中是否含有所述特异性引物对扩增产生的特异性目的片段;如果所述PCR扩增后的产物中含有所述特异性目的片段,则指示所述待测水稻为所述转基因水稻EB7001S或者含有权利要求1所述的核酸的衍生系。
3.根据权利要求2所述的方法,其中,所述特异性引物对包括针对SEQ ID No.1或SEQ ID No.1的片段的特异性引物对,该引物对中的一条引物在SEQ ID No.1的1-169bp区域设计、另一条引物在SEQ ID No.1的170-2071bp区域设计;所述特异性引物对包括SEQ ID No.9所示的核酸和SEQ ID No.10所示的核酸;所述特异性引物对扩增产生的目的片段的长度为485bp。
4.根据权利要求3所述的方法,其中,PCR扩增的条件包括,退火温度为56-61℃。
5.根据权利要求2所述的方法,其中,所述特异性引物对包括针对SEQ ID No.6或SEQ ID No.6的片段的特异性引物对,该引物对中的一条引物在SEQ ID No.6的1-1909bp区域设计、另一条引物在1910-2671bp区域设计;所述特异性引物对包括SEQ ID No.11所示的核酸和SEQ ID No.12所示的核酸;所述特异性引物对扩增产生的目的片段的长度为629bp。
6.根据权利要求5所述的方法,其中,PCR扩增的条件包括,退火温度为52-62℃。
7.一种试剂盒,该试剂盒包括右侧特异性引物对和/或左侧特异性引物对,其中,所述右侧特异性引物对包括SEQ ID No.9所示的核酸和SEQ ID No.10所示的核酸;所述左侧特异性引物对包括SEQ ID No.11所示的核酸和SEQ ID No.12所示的核酸。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其中,所述试剂盒还包括阳性对照核酸,所述阳性对照核酸包括SEQ ID No.1所示的核酸和/或SEQ ID No.6所示的核酸。
9.根据权利要求7或8所述的试剂盒,其中,所述试剂盒还包括dNTPs、PCR缓冲液和耐高温DNA聚合酶。
10.权利要求7-9中任意一项所述的试剂盒在检测转基因水稻EB7001S或者含有权利要求1所述的核酸的转基因水稻EB7001S的衍生系中的用途。
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