[发明专利]NOTCH3和JAG2基因SNP位点的用途

说明书

技术领域

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及NOTCH3和JAG2基因SNP位点的用途及相关试剂盒。 

背景技术

唇腭裂(Cleft Lip and/or Palate，CL/P)是主要的颅面发育畸形之一，代表了一类普遍的不致命的具有复杂病因和遗传异质性的出生缺陷。根据已有的数据表明，唇腭裂在全世界的发病率约为3.4-22.9/10000。在中国的发病率大约为：1.82/1000。不仅严重影响患者的面部美观，还因口、鼻腔相通，直接影响发育，经常招致患者上呼吸道感染，并能诱发中耳炎，对患者的身心健康有着严重的影响，会给那些患病儿童的家庭带来财政危机以及随之而来的社会负担，患儿可能会遇到一些在喂食，说话，听力及社会交往中的各种问题，虽经包括手术的一系列序列治疗，也很难达到完全正常的程度。国际上，唇腭裂根据是否涉及到其他明显或可认知的机构畸形常分为非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip and or palate，NSCL/P)和综合征性唇腭裂(syndromic cleft lip and or palate，SCL/P)。目前部分SCL/P的病因已明确，多为染色体异常或单基因病变，而NSCL/P作为一种复杂的多基因遗传病，是遗传因素和环境因素综合作用的结果。 

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是指存在于某一(些)群体、正常个体的基因组DNA中单碱基的序列差异，并且在人群中的分布频率至少要在1％以上(Brookes AJ.Gene，1999，234(2)：177-186)，人类遗传基因的多态性在遗传信息上的本质表现，90％以上是由SNP所引起的。因为其多态信息量大，目前已成为继限制性片段长度多态性(RFLP)标志和微卫星即短串联重复(STR)标志后的第三代遗传标志。 

从基础医学到临床医学的各个领域，SNP都存在巨大的应用价值。SNP的研究为基因诊断，尤其是疾病的早期诊断提供更多依据有重要意义。SNP由于其分布广、密度高而被期望在诸如癌症、糖尿病、高血压、忧郁症和哮喘等复杂疾病的研究中起重要作用，这些复杂疾病是多个遗传变异位点与环境因子共同作用的结果，由于发病原因复杂，涉及的基因数量多，已成为国际上疾病基因组学研究的重点。目前已有实验将SNP应用于肿瘤预后及易感性的判断，例如肺癌致癌物的易感性存在个体差异，即肺癌的基因易感性，研究较多的是代谢酶基因多态性，如人细胞色素P450-CYP450和髓过氧化酶MPO等。法国研究者证实，MPO基因启动子(463G/A)多态性导致该基因较低的表达，可以降低肺癌患病的危险性(ChewierI，Stucker l，Houllier AM，et al.pharmacogenetics，2003，13(2)：729-739)。日本学者发现了HER-2基因编码区的一个SNP与胃癌的发展及恶性程度有关(Kuraoka K，Matsumura S，Hamai Y，et al.Int J Cancer，2003，107(4)：593-596)。 

发明内容

本发明的目的是为早期诊断非综合征性唇腭裂易感性提供相应的解决方案。 

方案之一是：NOTCH3基因SNP位点和/或JAG2基因SNP位点在制备非综合征性唇腭裂易感性的诊断试剂盒中的应用； 

所述NOTCH3基因SNP位点为rs12082；所述JAG2基因SNP位点为rs2238286和/或rs741859。 

方案之一中，所述非综合征性唇腭裂为唇裂伴或不伴腭裂或单纯性腭裂。 

方案之一中，针对非综合征性唇腭裂易感性：当所述NOTCH3基因SNP位点rs12082的基因型中携带A时，非综合征性唇腭裂易感性增加；当所述JAG2基因SNP位点rs2238286的基因型为AG、GG或携带G时，非综合征性唇腭裂易感性增加。 

方案之一中，针对唇裂伴或不伴腭裂易感性：当所述NOTCH3基因SNP位点rs12082的基因型中携带A时，唇裂伴或不伴腭裂易感性降低；当所述JAG2基因SNP位点rs2238286的基因型为AG或携带G时，唇裂伴或不伴腭裂易感性降低。 

方案之一中，针对单纯性腭裂易感性：当所述JAG2基因SNP位点rs2238286的基因型为GG或携带G时，单纯性腭裂易感性降低；当所述JAG2基因SNP位点rs741859的基因型为CC或携带C时，单纯性腭裂易感性降低。