[发明专利]包括3334G>A突变的CYP2D6基因片段、所编码的蛋白质片段及其应用

权利要求书

1.核酸片段，所述核酸片段包含对应于SEQ ID NO.1的第3334位的突变位点，且是SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸，其中第3334位的核苷酸是A；或者所述核酸片段包含对应于SEQ ID NO.2的第1163位的突变位点，且是SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸，其中第1163位的核苷酸是A；或者为上述核酸片段的反向互补序列。

2.根据权利要求1所述的核酸片段，其特征在于，所述核酸片段的长度是10-100、101-200、201-500或501-1000个核苷酸；优选地，所述核酸片段的长度是10-20、21-30、31-40、41-50、51-60、61-100或101-300个核苷酸；进一步优选地，所述核酸片段是SEQ ID NO.1、2或14-18所示的序列。

3.等位基因特异性寡核苷酸，所述寡核苷酸与含有对应于SEQ ID NO.1的第3334位或对应于SEQ ID NO.2的第1163位的突变位点的等位基因片段或其反向互补序列全部或部分杂交，其中SEQ ID NO.1的第3334位或SEQ ID NO.2的第1163位的突变位点的核苷酸是A；所述等位基因片段是SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸或其反向互补序列。

4.根据权利要求3所述的等位基因特异性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是探针或引物；优选地，当所述寡核苷酸是探针时，所述寡核苷酸的长度是5-100个核苷酸；当所述寡核苷酸是引物时，所述寡核苷酸的长度是15-40个核苷酸；优选地，当所述寡核苷酸是探针时，所述突变位点位于探针序列的中心或大约中心处；当所述寡核苷酸是引物时，所述突变位点位于引物的3’末端。

5.根据权利要求4所述的等位基因特异性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是如SEQ ID NO.19-23所示的序列。

6.一种用于检测和/或分析单碱基突变的试剂盒，包括根据权利要求1或2所述的核酸片段或根据权利要求3-5任一项所述的等位基因特异性寡核苷酸，或包含能够作为引物扩增所述单碱基突变但不包含该单碱基的核酸片段；所述单碱基对应于SEQ ID NO.1的第3334位或SEQ ID NO.2的第1163位；优选地，所述试剂盒包含SEQ ID NO.6和/或SEQ ID NO.7和/或SEQ ID NO.12所示的序列片段。

7.根据权利要求1或2所述的核酸片段或根据权利要求3-5任一项所述的等位基因特异性寡核苷酸在检测CYP2D6基因突变中的应用，其中所述核酸片段或寡核苷酸用作探针或引物；或者在制备检测CYP2D6基因突变的药物中的应用；或者用作检测CYP2D6基因突变的检验标志物的应用。

8.一种用药指导，包括检测待测样品中CYP2D6基因的对应于SEQ ID NO.1的第3334位或SEQ ID NO.2的第1163位的碱基，当所述位点的碱基是A时，调整经CYP2D6代谢的药物的给药量。

9.一种分析核酸的方法，所述方法包括分析待测样品中的包含对应于SEQ ID NO.1的序列的核酸中对应于第3334位的核苷酸或分析待测样品中的包含对应于SEQ ID NO.2的序列的核酸中对应于第1163位的核苷酸；优选地，所述方法是测序法、限制性片段长度多态性分析或探针杂交法。

10.CYP2D6蛋白或其片段或变异体，所述蛋白序列为SEQ ID NO.3所示的序列；所述片段或变异体包含对应于SEQ ID NO.3的第388位的组氨酸，且为SEQ ID NO.3所示的氨基酸序列的至少10个连续氨基酸。