[发明专利]采用EST-SSR标记进行花椰菜品种鉴定的方法在审
申请号: | 201310409457.3 | 申请日: | 2013-09-09 |
公开(公告)号: | CN104419762A | 公开(公告)日: | 2015-03-18 |
发明(设计)人: | 赵新;刘莉莉;王永;王超楠;兰青阔;李梅;陈锐;朱珠;郭永泽;景海春 | 申请(专利权)人: | 天津市农业质量标准与检测技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 300195 *** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 采用 est ssr 标记 进行 花椰菜 品种 鉴定 方法 | ||
1.用于花椰菜品种鉴定的EST-SSR引物,其特征在于,包括5对EST-SSR引物:
HYC33上游引物序列:5'-AGACTTCGTCGATCCACCTG-3’,HYC33下游引物序列:5'-GACCTCGTCCTCCTCTTCCT-3’BC5上游引物序列:5'-CAAGAGTCCAAAAGCCGAAC-3’,BC5下游引物序列:5’-CCTTGCTTGCATCAGTTTCA-3’;HYC10上游引物序列:5’-CATGAAAGGCGAAGAGAAGC-3’,HYC10下游引物序列:5'-ACACACCCAAGGCTTGTAGG-3’;BC20上游引物序列:5’-CCACCATCGCTTCTCAGATT-3’,BC20下游引物序列:5'-GTCTCGTCAGGCCTCTTTTG-3’;BC28上游引物序列:5'-TAACTTCTCCCCCGTCCTCT-3’,BC28下游引物序列:5'-GAGATGGCTACAGTGGCTCC-3’。
2.一种采用EST-SSR标记进行花椰菜品种鉴定的方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)采用权利要求1所述的EST-SSR引物对供试品种样品模板DNA进行PCR扩增,其中的PCR扩增反应的总体积为10μL,扩增反应体系为:2×Master Mixes5μL,上游和下游引物10μmol/L各0.25μL,供试品种花椰菜杂交种基因组DNA模板,浓度100ng/μL,1μL,双蒸水补足10μL;PCR反应程序为95℃预变性2min;32个扩增循环,94℃40sec,56℃45sec,72℃1min;72℃延伸7min,4℃保存;
(2)对PCR扩增产物进行凝胶电泳,非变性聚丙烯酰胺凝胶浓度为8%,凝胶组分为:去离子水21mL,10×TBE3mL,40%PAG6mL,TEMED30μL,10%过流酰胺300μL;设定电压250V,电泳1h,关闭电源,进行染色;染色过程:银染8~10min,迅速水洗,NaOH显色数分钟,直至条带清晰即可,再次水洗;
(3)通过分析EST-SSR结果,比较13份花椰菜品种间多态性位点的差异,确定引物的多态率及多态信息量;在相同迁移率位置上进行“1,0”标注,构建13份花椰菜品种的SSR分析谱带数据,通过数据分析5对引物是否可对13份花椰菜品种进行完全的区分,同时构建13份花椰菜品种的指纹图谱。
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