[发明专利]聋病易感基因线粒体12SrDNA 1555A>G、1494C>T突变比例检测试剂盒在审
申请号: | 201310410840.0 | 申请日: | 2013-09-11 |
公开(公告)号: | CN103451302A | 公开(公告)日: | 2013-12-18 |
发明(设计)人: | 步迅;夏子芳;张全芳;刘艳艳 | 申请(专利权)人: | 步迅;夏子芳 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 250100 山东省济南市历城区*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 聋病易感 基因 线粒体 12 srdna 1555 1494 突变 比例 检测 试剂盒 | ||
1.聋病易感基因线粒体12SrDNA1555A>G、1494C>T突变比例检测试剂盒,其特征在于包括扩增试剂和一系列标准品;所述扩增试剂包括:PCR缓冲液、MgCl2和dNTPs的反应混合物,Taq酶,超纯水,高特异性扩增线粒体12SrDNA:1494C>T、1555A>G的引物混合物,对上述位点进行特异性检测的探针混合物,对人线粒体DNA进行检测的通用探针混合物,内对照及对内对照进行检测的引物探针混合物;所述一系列标准品包括:1494C>T突变比例标准品、1555A>G突变比例标准品。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
用于线粒体12SrDNA:1494C>T、1555A>G检测,人线粒体DNA序列检测的引物为:
SEQ NO.1:5’-GTAAGTTGGGTGCTTTGTGTTAAG-3’
SEQ NO.2:5’-GCCCTGAAGCGCGTACA-3’;
用于线粒体12SrDNA1555A>G突变检测的探针为:
SEQ NO.3:5’-AGTACACTTACCATGTTACGACTTGCCTCCTC-3’
用于线粒体12SrDNA1494C>T突变检测的探针为:
SEQ NO.4:5’-GTGAAGTATACTTGAGGAGaGTGACGGGAC-3’;
用于对人线粒体DNA进行检测的通用探针为:
SEQ NO.5:5’-TGCGTAGGGGTTTTAGTTAAATGTCCT-3’
其中LNA核苷以黑体字表示。
3.根据权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述的内对照为一段人工合成的序列装载到pMD18-T的质粒载体上得到,这段人工合成的序列(SEQ NO.6)经过NCBI网站Blast没有找到高相关的同源区。扩增序列及对内对照进行检测的引物探针为:
SEQ NO.6:CACCAGCATCTCCCTTCATGTTGACTACCGTAGGCTGCCACCATTTCAGAAGAACGATGACCCCTTGCTAGCAGTGGAAGAGTTGCATGAAGGTAATATACTCGATCCGTAATTCCACTATTGAAATGGGTACATGACTGATACAGACCATC
SEQ NO.7:5’-CACCAGCATCTCCCTTCATGT-3’
SEQ NO.8:5’-GATGGTCTGTATCAGTCATGTACCCA-3’
SEQ NO.9:5’-GAACGATGACCCCTTGCTAGCAGTGGAAGAG-3’
4.根据权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述的用于线粒体12SrDNA:1494C>T、1555A>G突变检测的探针,对人线粒体DNA进行检测的通用探针,内对照探针,每条探针的5’端和3’端均进行荧光染料标记,5’端为发光基团和3’端为淬灭基团。
5.根据权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述用于对线粒体12SrDNA:1494C>T、1555A>G突变进行特异性检测的探针,对人线粒体DNA进行检测的通用探针,内对照探针分为四组,分别采用四种不同的发光基团对各组探针的5’端进行标记,3’端的淬灭基团可以为相同或不同的荧光染料。
6.根据权利4要求所述的试剂盒,其特征在于:探针所分为的四组为:用于对内对照进行特异性检测的探针采用同一组发光-淬灭基团;线粒体12SrDNA:1494C>T突变进行特异性检测的探针采用同一组发光-淬灭基团;1555A>G突变进行特异性检测的探针采用同一组发光-淬灭基团;对人线粒体DNA进行检测的通用探针采用同一组发光-淬灭基团。
7.根据权利4要求所述的试剂盒,其特征在于:5’端不同的发光基团所使用的荧光染料可以为:ALEXA Fluor350、FAM、TET、HEX/JOE/VIC、Cy3、TAMRA、ROX、/Texas Red、Cy5;3’端相同或不同的淬灭基团所使用的荧光染料可以为:BHQ1、BHQ2、TAMRA、DABCYL。
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