[发明专利]用于检测EGFR基因热点突变的引物、试剂盒和检测方法无效
申请号: | 201310537369.1 | 申请日: | 2013-11-04 |
公开(公告)号: | CN103602734A | 公开(公告)日: | 2014-02-26 |
发明(设计)人: | 梁超;熊凯;程宇;邢军英;刘晓峰;侯然;朱立文;王绪华;方国伟;黄士昂;陈忠 | 申请(专利权)人: | 北京海思特临床检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 | 代理人: | 陆军 |
地址: | 100176 北京市大兴区亦*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 egfr 基因 热点 突变 引物 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明属于分子生物学技术领域,涉及基因突变检测引物和试剂盒,尤其涉及一种用于检测EGFR基因热点突变的引物、试剂盒和检测方法。
背景技术
表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是一种跨膜受体酪氨酸激酶,属于受体酪氨酸激酶(tyrosine kinase,TK)erbB/HER家族的一个成员,EGFR的激活即磷酸化对调节肿瘤细胞的生长、侵袭、转化、存活、血管生成及转移具有重要意义,研究表明,EGFR在许多恶性肿瘤中过高表达。
近年来,随着医学分子生物学的发展,分子靶向治疗作为恶性肿瘤治疗的新手段,正日益受到临床工作者们的重视,因此,EGFR作为恶性肿瘤治疗的分子靶标而受到普遍关注。目前已开发出了吉非替尼(gefitinib)和厄洛替尼(erlotinib)等表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(epidermal growth factor receptor tyrosine kinases inhibitor,EGFR-TKI),然而在临床中,有些患者对EGFR-TKI的治疗并不敏感或对该类药物产生耐药,故对EGFR-TKI耐药机制的探索成为国内外研究的热点。
研究表明,这些靶向药物的敏感性及耐药性与肿瘤细胞EGFR突变密切相关。目前,在约半数耐药患者中发现了EGFR第20外显子T790M(T790M,threonine at position790)突变;而EGFR第19号外显子内缺失突变和第21外显子L858R突变则使突变细胞对药物亲和力增高,作用时间延长,对EGFR-TKI的敏感性增高。因此,在一线治疗的恶性肿瘤患者中检测EGFR基因突变具有重要的临床意义,是决定患者是否能够应用EGFR-TKI治疗的先决条件。
目前检测EGFR突变主要通过直接测序法,该方法需要取得肿瘤组织标本,通过石蜡组织DNA提取,再进行PCR扩增、测序,最后对测序数据进行分析。这个方法对石蜡包埋组织标本要求高,要求标本中肿瘤组织含量达20%以上,检测敏感度低,检测流程复杂繁琐,对数据分析要求高,且目前无商用试剂盒,对实验室的仪器配备要求也较高。
发明内容
为了解决上述技术问题,本发明的目的在于提供一种用于检测EGFR基因热点突变的引物,本发明还公开了包括有该引物的试剂盒及其使用方法。
本申请的发明人根据EGFR基因的第19号外显子内缺失突变(EXON19缺失突变)、第20外显子T790M突变(EXON20T790M)和第21外显子L858R突变(EXON21L858R)设计并合成了特异性引物,以外周血为样本提取基因组DNA,可以快速检测EGFR基因中这三处热点突变,检测敏感度高,可更高效地筛查出适宜EGFR-TKI治疗方案的恶性肿瘤患者。
根据本发明的实施例,提供了一种用于检测EGFR基因热点突变的引物,所述引物序列如下:
SEQ ID NO:1 5’-ATCCCAGAAGGTGAGAAAGATAAAATTC-3’
SEQ ID NO:2 5’-CCTGAGGTTCAGAGCCATGGA-3’
SEQ ID NO:3 5’-AGAGCCATGGACCCCCACAC-3’
SEQ ID NO:4 5’-CGAAGCCACACTGACGTGC-3’
SEQ ID NO:5 5’-CGAAGGGCATGAGCCGC-3’
SEQ ID NO:6 5’-CCTCCAGGAAGCCTACGTGA-3’
SEQ ID NO:7 5’-CAGCCAGGAACGTACTGGTGA-3’
SEQ ID NO:8 5’-TCCCTGGTGTCAGGAAAATGCT-3’
SEQ ID NO:9 5’-CGCAGCATGTCAAGATCACAGAT-3’。
根据本发明的实施例,还提供了一种用于检测EGFR基因热点突变的试剂盒,其主要包括:1)引物,所述引物序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:9所示,PCR MIX反应液,针对不同突变进行酶切的限制性内切酶,BSA溶液, 酶切缓冲液,阴性对照品,阳性对照品,去离子水;2)分隔并集中包装这些试剂的瓶或管以及包装盒。
优选的,上述引物的浓度均为5~10μmol/L。
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