[发明专利]甘蔗毛细管电泳DNA指纹图谱的构建及甘蔗品种资源鉴定的方法无效

专利信息
申请号: 201310540631.8 申请日: 2013-11-05
公开(公告)号: CN103540678A 公开(公告)日: 2014-01-29
发明(设计)人: 周会;潘永保;李杨瑞;杨荣仲 申请(专利权)人: 广西壮族自治区农业科学院甘蔗研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 广西南宁公平专利事务所有限责任公司 45104 代理人: 黄永校
地址: 530007 广西壮族*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 甘蔗 毛细管 电泳 dna 指纹 图谱 构建 品种 资源 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.一种甘蔗毛细管电泳DNA指纹图谱的构建方法,其特征在于,包括下述步骤:

1)甘蔗DNA提取:按CTAB、SDS或者DNA提取试剂盒的方法提取甘蔗DNA;

2)甘蔗DNA的PCR扩增:以提取的甘蔗DNA为模板进行PCR扩增,采用的引物为SSR引物;

3)PCR扩增产物的分析:采用毛细管电泳分析PCR扩增产物,记录毛细管电泳图谱;

4)毛细管电泳图谱有效特征数据采集,包括对应PCR扩增产物的大小的电泳峰的位置、电泳峰的高度、电泳峰的面积;

5)毛细管电泳图谱有效特征数据的标准化,将电泳峰高度最高或者电泳峰面积最大的电泳峰的特征数据标准化为1,其余电泳峰则通过其电泳峰高度与最高电泳峰的比值或者电泳峰面积与最大电泳峰的比值来标准化;

6)利用对应PCR扩增产物的大小的电泳峰的位置及其对应的电泳峰特征数据标准化值构建甘蔗DNA指纹图谱。

2.一种甘蔗毛细管电泳DNA指纹的鉴定方法,其特征在于,包括下述步骤:

1)甘蔗样品DNA提取:按CTAB、SDS或者DNA提取试剂盒的方法提取甘蔗DNA;

2)甘蔗样品DNA的PCR扩增:以提取的甘蔗DNA为模板进行PCR扩增,采用的引物为SSR引物;

3)PCR扩增产物的分析:采用毛细管电泳分析PCR扩增产物,记录毛细管电泳图谱;

4)甘蔗样品毛细管电泳DNA指纹图谱的建立:以所述构建甘蔗毛细管电泳DNA指纹图谱的构建方法建立甘蔗样品的DNA指纹图谱;

5)甘蔗样品鉴定:利用相关分析算法比较样品DNA指纹图谱与甘蔗DNA指纹图谱数据库中DNA指纹图谱的相关性,根据相关系数对甘蔗样品DNA进行鉴定。

3.如权利要求1所述的甘蔗毛细管电泳DNA指纹图谱的构建方法,其特征在于,所述甘蔗DNA指纹图谱为甘蔗属甘蔗杂交品种或者种质资源DNA指纹图谱。

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