[发明专利]一种热带植物多糖多酚小RNA提取方法有效
申请号: | 201310547550.0 | 申请日: | 2013-11-06 |
公开(公告)号: | CN103740698B | 公开(公告)日: | 2017-01-04 |
发明(设计)人: | 张欣;彭军;张贺;蒲金基;谢艺贤;漆艳香 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 广州三环专利代理有限公司44202 | 代理人: | 郝传鑫,陈欢 |
地址: | 571101 海*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 热带 植物 多糖 多酚小 rna 提取 方法 | ||
1.一种热带植物多糖多酚小RNA提取方法,其特征在于,该热带植物多糖多酚小RNA提取方法包括以下步骤:
步骤一、采样热带植物叶片,冻入液氮,-80℃保存;
步骤二、准备小RNA提取的试剂,CTAB裂解缓冲液、PEG8000沉淀缓冲液、EDC交联缓冲液、miRNANorthernblotting杂交缓冲液、7%dPAGE、WashingBuffer;
步骤三、按照小RNA提取的预处理、Trizol抽提、分级沉淀高分子量RNA、沉淀小RNA,提取小RNA;
步骤四、按照17%dPAGE分离、转膜及交联、miRNA杂交及洗膜、小RNA杂交及洗膜、曝光及保存,实现RNA杂交;
步骤五、miRNAstem-loopRT-PCR扩增;
步骤六、开展多糖多酚植物小RNA的提取以及检测分析。
2.如权利要求1所述的热带植物多糖多酚小RNA提取方法,其特征在于,在步骤二中,提取小RNA的试剂如下:
CTAB裂解缓冲液:4M异硫氰酸胍,2%w/vCTAB,100mMTris-HCLpH8.5,25mMEDTA,2MNaCl,2%w/vPVP-40,and2%v/v2-巯基乙醇;
PEG8000沉淀缓冲液:20%w/vPEG8000,1MNaCl;
EDC交联缓冲液12ml:122.5μl12.5M1-甲基咪唑pH8.0,0.373g1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐;
miRNANorthernblotting杂交缓冲液:5×SSC,20mMNaHPO4pH7.2,7%SDS,3×Denhardt`s溶液;
17%dPAGE:尿素12.6g,水1.25ml,10×TBE1.5ml,Acr/Bis30%17ml,在微波炉中溶解尿素,待冷却后加入240μl10%AP,混匀后再加入10μlTEMED;
WashingBuffer:2×SSC,0.1%SDS。
3.如权利要求2所述的热带植物多糖多酚小RNA提取方法,其特征在于,在步骤三中,小RNA提取的具体方法如下:
第一步,预处理:
取2g~3g叶片液氮研磨后将粉末转入DEPC处理过的50ml的离心管中,加入20ml的CTAB-PVPP裂解缓冲液,涡旋不少于30s后将裂解产物放在室温3分钟~5分钟,然后12000g4℃离心5min;
第二步,Trizol抽提:
离心后的上清转入一干净的50-ml离心管,加入等体积的Trizol试剂,充分涡旋后室温放置5min~10min;加入4ml氯仿:异戊醇,氯仿:异戊醇的比值为24:1,涡旋后静置3min离心,1,2000g4℃离心10min;
第三步,分级沉淀高分子量RNA:
离心后上清转入另外50ml离心管,65℃孵育15min,然后加入等体积的PEG8000沉淀缓冲液,涡旋后马上冰浴30min~45min后离心10min沉淀高分子量RNA;
第四步,沉淀小RNA:
离心后的上清液加入1/10体积的3MNaAcpH5.2和2.5倍体积的预冷的无水乙醇,-20℃沉淀过夜,1,2000g4℃离心20min,沉淀用80%的乙醇洗涤1次~2次,DEPC水溶解后放入-80℃备用。
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