[发明专利]水仙BES-SSR标记引物 TCA5及鉴定水仙品种的方法有效
申请号: | 201310562044.9 | 申请日: | 2013-11-13 |
公开(公告)号: | CN103555853A | 公开(公告)日: | 2014-02-05 |
发明(设计)人: | 潘东明;祁世明;潘腾飞;林琳;郭志雄 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水仙 bes ssr 标记 引物 tca5 鉴定 品种 方法 | ||
1.一种水仙BES-SSR标记引物TCA5,由上游引物TCA5F和下游引物TCA5R组成,其特征在于核苷酸序列如下:
TCA5 F: 5'-GCAGTTTCCGCAAGTTTAG-3'
TCA5 R: 5'-CACCCAGAAGACTGACGAG-3'。
2.利用如权利要求1所述的水仙BES-SSR标记引物TCA5鉴定水仙品种的方法,包括水仙基因组总DNA提取、PCR总反应体系建立、PCR扩增程序、聚丙烯酰胺凝胶电泳条件和PCR扩增产物的检测鉴定,其特征在于:
(1)水仙基因组总DNA提取:利用改良的CTAB法提取水仙基因组总DNA;
(2)PCR总反应体系建立:总反应体系20ul:供鉴定的水仙基因组总DNA 50ng,10×PCR Buffer 2ul,10mmol/L dNTPs 0.5ul,10mmol/L水仙TCA5上下游引物各1.0ul,5U/L Taq DNA聚合酶 0.2ul,无菌ddH2O 12.8ul;所述供鉴定的水仙,本发明共提供24份水仙品种样品;
(3)PCR扩增程序:94℃预变性4min,94℃变性30s,52℃退火30s,72℃ 延伸45s,共35个循环,72℃延伸10min,4℃保存;
(4)聚丙烯酰胺凝胶电泳条件:1×TBE电泳缓冲液,体积比为8%的聚丙烯酰胺凝胶,在电压400V,电流100mA下电泳3.0h后用银染法染色,经ImageScanner Ⅲ凝胶扫描仪扫描保存;
(5)PCR扩增产物的检测鉴定:利用水仙BES-SSR标记引物TCA5,对24份水仙的样品进行品种鉴定,于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测的PCR扩增图谱中,在分子量为224bp的位置出现DNA条带,则该品种为中国多花水仙金盏银台;在分子量为340bp的位置出现DNA条带,则该品种为中国多花水仙重瓣玉玲珑;在分子量为332bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Replete;在分子量为142bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋小冠水仙Alltruist;在分子量为151bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙Jetfire;在分子量为153bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Tahiti;在分子量为115bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋裂冠水仙Orangerie;在分子量为226bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Yellow Cheerfulness;在分子量为144bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋红口水仙Recurvus;在分子量为236bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙Erlicheer;在分子量为369bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋三蕊水仙Thalia;在分子量为123bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋喇叭水仙Mount Hood;在分子量为195bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙White Favourite;在分子量为321bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋长寿花水仙Silver Smiles;在分子量为141bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Pink Charm;在分子量为346bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Johann Strauss;在分子量为319bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋小冠水仙Barret Browning;在分子量为163bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋喇叭水仙Dutch Master;在分子量为117bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Fortissimo;在分子量为164bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Daydream;在分子量为101bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Gay Tabor;在分子量为251bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋仙客来水仙Tete-a-Tete;在分子量为213bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Bella Vista;在分子量为143bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Carlton。
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