[发明专利]一种判断晚期胃癌治疗疗效的试剂盒及其使用方法有效
申请号: | 201310581683.X | 申请日: | 2013-11-18 |
公开(公告)号: | CN103614468A | 公开(公告)日: | 2014-03-05 |
发明(设计)人: | 蒋敬庭;吴昌平;鞠景芳;郑晓;刘娟 | 申请(专利权)人: | 常州市第一人民医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 常州市英诺创信专利代理事务所(普通合伙) 32258 | 代理人: | 任晓岚;王美华 |
地址: | 213003 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 判断 晚期 胃癌 治疗 疗效 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种判断晚期胃癌治疗疗效的试剂盒,其特征在于由三个独立包装或组合包装的试剂盒组成:RNA提取试剂盒、RT-PCR反应试剂盒和实时定量PCR反应试剂盒,依次使用三个试剂盒能检测出胃癌组织中miR-129的表达水平,miR-129表达水平低说明预后好。
2.权利要求1所述的判断晚期胃癌治疗疗效的试剂盒,其特征在于RNA提取试剂盒含有2ml的消毒离心管,1.5ml二甲苯,1.5ml无水乙醇蛋白酶K50μl,Trizol试剂1ml、氯仿200ul、异丙醇500ul、显色剂1ul、75%乙醇1ml和无核酸酶水10-50ul。
3.权利要求1所述的判断晚期胃癌治疗疗效的试剂盒,其特征在于RT-PCR试剂盒含有10mM dNTPs0.15ul,50U/ul逆转录酶1ul,10倍浓度PH7.5的逆转录缓冲液1.5ul,20U/ul RNA酶抑制剂0.19ul,购自Applied Biosystem的5倍浓度miR-129特异性逆转录引物3ul和无核酸酶水6.66ul。
4.权利要求1所述的判断晚期胃癌治疗疗效的试剂盒,其特征在于实时定量PCR反应试剂盒含有TaqMan2倍浓度通用PCR总混合物10ul、无核酸酶水7.67ul和购自Applied Biosystem的20倍浓度miR-129特异性PCR引物1ul。
5.权利要求1至4任一项试剂盒的使用方法:
a、使用RNA提取试剂盒
1)将10张5μm厚连续切片(切片机和刀片均经75%乙醇溶液消毒2次)的蜡膜放于2ml的消毒离心管里,加入1.5ml二甲苯,盖紧并充分混匀去除石蜡,55℃孵育10min,室温下12000r/min离心2min,弃去上清液,重复1次;
2)加入1.5ml无水乙醇,充分混匀以去除二甲苯,室温放置10min,室温下12000r/min离心2min,弃去上清液,重复2次;
3)打开离心管盖子,室温或37℃晾干,约10min,直到乙醇完全挥发;
4)加细胞裂解液250μl,混匀,加蛋白酶K50μl,56℃消化1h,直到样品完全裂解;
5)90℃孵育15min,4℃8000r/min离心,弃去沉淀;
6)加入1ml TRIzol溶液,用1000μl移液器反复抽吸匀浆,室温放置5min,使样品充分裂解;
7)每1ml的TRIzol溶液中加入200μl的氯仿,充分振荡混匀后室温放置3-5min使其自然分相;
8)4℃12000r/min离心10-15min。混合溶液会分成三层:下层为黄色的有机相,中间层和上层无色的水相。RNA主要在水相中,把上层的水相(通常可吸取550μl左右)转移到新离心管中;注意不要吸取中间界面,否则将导致RNA样品中有DNA污染;
9)加入等体积冰冷的异丙醇和1ul显色剂,充分混匀以沉淀其中的RNA,室温放置10-20min。4℃12,000rpm离心10min,弃上清,RNA沉淀于管底,可见蓝色沉淀;
10)4℃12000r/min离心10min,弃去上清液,RNA沉淀于管底和管壁;
11)RNA沉淀中加入1ml75%乙醇溶液,温和振荡离心管,悬浮沉淀;
12)4℃8000r/min离心1-2min,用移液器小心吸取并弃去上清液,注意不要吸弃沉淀;室温放置1-2分钟晾干沉淀。注意RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解;
13)沉淀中加入10-50μl DEPC水,轻弹管壁,以充分溶解RNA,放置于-80℃冰箱保存;
b、使用RT-PCR试剂盒:
1)、将10mM dNTPs0.15ul,逆转录酶1ul,10倍浓度PH7.5的逆转录缓冲液1.5ul,20U/ul RNA酶抑制剂0.19ul,购自Applied Biosystem的5倍浓度miR-129特异性逆转录引物3ul、无核酸酶水6.66ul、2.5ul RNA试剂盒提取的样品混匀瞬离,分装,加入对应的模板混匀,再加入无核酸酶水至总体系为15ul;
2)、将步骤1的材料在普通PCR仪上进行逆转录,16℃保持30min,42℃保持30min,85℃保持5min,4℃保存;
c、使用实时定量PCR试剂盒:
1)将10ul TaqMan2倍浓度通用PCR总混合物、7.67ul无核酸酶水、1ul购自Applied Biosystem的20倍浓度miR-129特异性PCR引物、RT-PCR试剂盒获得的miRNA逆转录产物1.33ul混匀;
2)在普通PCR仪上反应,a)95℃保持10min,b)95℃保持15s,c)60℃保持60s,d)重复步骤b)、c)45次,g)4℃保存。
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