[发明专利]斑玉蕈菌株SIEF2632的分子标记、检测方法与应用有效

专利信息
申请号: 201310630944.2 申请日: 2013-12-02
公开(公告)号: CN104673787B 公开(公告)日: 2019-05-31
发明(设计)人: 陈辉;潘越;冯志勇;陈明杰;汪虹 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6895
代理公司: 上海世贸专利代理有限责任公司 31128 代理人: 李浩东
地址: 201403 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 斑玉蕈 菌株 sief2632 分子 标记 检测 方法 应用
【说明书】:

发明公开了一种斑玉蕈SIEF2632菌株的分子标记、检测方法与应用,所述斑玉蕈菌株SIEF2632的分子标记,其特征在于,该分子标记是基因SCAR的分子特异检测标记,其PCR扩增的专用引物是SIEF2632F/R,其中:SIEF2632F是:5'AACACTGAATCATCCTCCTC 3';SIEF2632R是:5'AGTCGCCATGATGCTTTT 3'。本发明具有检测时间短,准确性高的优点。该方法在所收集的我国20个斑玉蕈菌种中具有菌株SIEF2632的专一性。

技术领域

本发明属于斑玉蕈菌种的检测领域,特别是涉及一种斑玉蕈菌株SIEF2632的分子标记、其检测方法与应用。

背景技术

我国从20世纪80年代起对斑玉蕈开展生物学特性和栽培条件研究,目前已经在多个省、市推广栽培。斑玉蕈味道鲜美,是一种珍稀食用菌品种,在国内外都受到食用菌生产行业的重视,其在日本、韩国和国内上海等地已经实现了工厂化生产模式,且效益良好。近十年来,斑玉蕈的市场需求日益增多,中国斑玉蕈以惊人的发展速度,优良的品质和丰富的食用及药用价值为世界菇业人士瞩目。

优质菌种在斑玉蕈单产和质量中的贡献率举足轻重,因此斑玉蕈菌种在其产业中占有非常重要的地位。在我国,随着大规模的工厂化栽培方式的出现,对斑玉蕈菌种质量的要求越来越高。因此,需要发展更为简便、快速、准确的菌株鉴定技术,以保证每批次的用种都准确无误。这就需要我们进一步对菌种鉴定技术进行研究,在斑玉蕈的研究中引进更为有效的菌种鉴定体系。

DNA分子标记技术在食用菌菌种和菌株鉴定的研究中发挥了巨大的作用,不仅极大地提升了食用菌的基础和应用研究,同时也为这一领域研究的深入和拓展展现了光明的前景。使用DNA分子标记技术对菌株进行检测,与传统的形态学检测、拮抗试验、结实性实验等相比,具有操作简便、成本低、检测时间短、准确性高等优越性。

斑玉蕈菌株SIEF2632在RAPD、SSR等遗传图谱分析显示,与其它斑玉蕈菌株亲缘关系较远。与其他常规斑玉蕈栽培菌株相比,其具有原基形成晚(其他菌株搔菌后10天左右出现原基,而SIEF2632到第16天才出现原基),畸形率高(极易形成瘤盖菇)等明显的缺点,因此,斑玉蕈SIEF2632菌株的相关农艺性状不适宜作为生产用栽培菌种。而在菌丝生长阶段与其他菌株并无明显外部形态差异,为此,需要采用一种快速、准确的方法对斑玉蕈菌株SIEF2632进行鉴定,以避免将其误当作为生产用栽培菌种而带来不必要的损失。

发明内容

本发明的目的是提供一种斑玉蕈菌株SIEF2632的分子标记、其检测方法与应用。

本发明通过采用PCR技术,经过筛选试验,获得斑玉蕈菌株SIEF2632的特异DNA片段,以此片段的DNA序列为基础,设计特异性PCR扩增引物,通过对斑玉蕈菌种SIEF2632的特异片段的检测从而对斑玉蕈菌株SIEF2632进行鉴定和检测。

本发明的一种斑玉蕈菌株SIEF2632的分子标记,是基因SCAR的分子特异检测标记,其PCR扩增的专用引物是SIEF2632F/R,其中:

SIEF2632F是:5' AACACTGAATCATCCTCCTC 3';

SIEF2632R是:5' AGTCGCCATGATGCTTTT 3';

PCR产物大小为397bp。

扩增出的SCAR片段序列如下:

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