[发明专利]基于EST-SSR标记鉴定枇杷品种的方法有效
申请号: | 201310671755.X | 申请日: | 2013-12-03 |
公开(公告)号: | CN103667487A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
发明(设计)人: | 李晓颖;陈俊伟;徐红霞 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 310021 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 est ssr 标记 鉴定 枇杷 品种 方法 | ||
1.一种基于EST-SSR标记鉴定枇杷品种的方法,其特征在于:所用来鉴定枇杷品种的引物是通过针对枇杷EST序列设计的SSR引物,经3次筛选出条带清晰、多态性好的引物,具体包括:
2.根据权利要求1所述的基于EST-SSR标记鉴定枇杷品种的方法,其特征在于:具体包括如下步骤:
(1)提取需要进行鉴定、区分的枇杷DNA,稀释备用;
(2)利用引物EJ-38对枇杷DNA进行PCR扩增并进行PAGE凝胶检测,在223bp、227bp都出现特征性谱带,而245bp无特征性谱带,1.‘大五星’、13.‘六分种’、17.‘尖头大红袍’三个枇杷品种被分成A组;在227bp、245bp都出现特征性谱带,在223bp无特征性谱带,3.‘宁海白’、4.‘溪上白沙’、6.‘荸荠种’、7.‘冠玉’、10.‘白玉’、14.‘白毛五儿’六个枇杷品种被分为B组;在223bp、227bp都无特征性谱带,只在245bp出现特征性谱带,编号为5.‘洛阳青’、9.‘青种’、11.‘甜种’、15.‘大玫瑰红袍’、18.‘宝珠’五个枇杷品种被分成C组;在223bp、245bp都无特征性谱带,只在227bp出现特征性谱带,编号为8.‘鸡蛋白’、16.‘大叶杨墩’两个枇杷品种被分成D组;在223bp、227bp、245bp都无特征性谱带,编号为2.‘大房’12.‘迟红’两个枇杷品种被分成E组,并进入步骤(3);
(3)进一步利用引物EJ-25进行PCR扩增并进行PAGE凝胶检测,根据在160bp、210bp、216bp和220bp出现的特征性谱带区分A、B、C、D、E五组中的枇杷品种:
在A组中,在160bp处无特征带、而在210bp处出现特征性谱带则品种1.‘大五星’被区分出来;若在160bp、220bp都出现特征性谱带则品种13.‘六分种’被区分出来;在160bp、210bp都出现特征性谱带则品种17.‘尖头大红袍’被区分出来;
在B组中,在216bp都出现特征性谱带,则品种7.‘冠玉’被区分出来,而3.‘宁海白’、4.‘溪上白沙’、6.‘荸荠种’、10.‘白玉’、14.‘白毛五儿’五个品种在216bp无特征性谱带,进入步骤(4);
在C组中,在220bp有特征性谱带,在160bp处无特征带,品种11.‘甜种’被区分鉴定出来;而在210bp有特征性谱带,在160bp处无特征带,品种18.‘宝珠’被鉴定出,其余三个品种5.‘洛阳青’、9.‘青种’、15.‘大玫瑰红袍’仅在160bp有特征带,则进入步骤(4);
在D组中,在160bp处无特征带,品种8.‘鸡蛋白’被区分鉴定出来;而在160bp处有特征性谱带的,品种16.‘大叶杨墩’则被区分出来;
在E组中,在210bp无特征性谱带,品种2.‘大房’被区分鉴定出来;而在210bp处有特征性谱带的,品种12.‘迟红’被鉴定出来;
(4)利用引物EJ-20进行PCR扩增,并进行PAGE凝胶检测,
在B组中,在200bp处出现特征性谱带,品种3.‘宁海白’、6.‘荸荠种’、14.‘白毛五儿’三个品种被分为一组;品种4.‘溪上白沙’和10.‘白玉’在200bp处无特征性谱带,被分为另一组,继续进入步骤(5);
在C组中,在200bp有特征性谱带,品种15.‘大玫瑰红袍’被鉴定出来,而品种5.‘洛阳青’和9.‘青种’则进入步骤(5);
(5)利用引物EJ-16和EJ-40分别进行PCR扩增,并进行PAGE凝胶检测,
在B组中,利用引物EJ-40对品种3.‘宁海白’、6.‘荸荠种’、14.‘白毛五儿’三个品种进行扩增并检测,在236bp、238bp处均出现特征性谱带的,品种3.‘宁海白’被鉴定出来;仅在236bp处出现特征性谱带,而在238bp处无特异谱带的为品种14.‘白毛五儿’;仅在238bp处出现特征性谱带,而在236bp处无特异谱带的为品种6.‘荸荠种’;
利用引物EJ-16对品种4.‘溪上白沙’和10.‘白玉’进行扩增并PAGE检测,在172bp处出现特征性谱带的,为品种4.‘溪上白沙’;而无该特异条带的则为品种10.‘白玉’,至此B组所有枇杷品种都被鉴定出来;
在C组中,利用引物EJ-16对品种5.‘洛阳青’和9.‘青种’扩增并进行PAGE检测,在172bp处出现特征性谱带的,为品种9.‘青种’;而无该特异条带的则为品种5.‘洛阳青’,至此C组所有枇杷品种也都被鉴定出来。
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