[发明专利]一种简并引物及利用该简并引物检测马铃薯Y病毒属病毒的方法有效
申请号: | 201310716604.1 | 申请日: | 2013-12-20 |
公开(公告)号: | CN103642804A | 公开(公告)日: | 2014-03-19 |
发明(设计)人: | 章绍延;王健华;刘志昕;张雨良;余乃通;张秀春;周朋;梁洁 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 郑州联科专利事务所(普通合伙) 41104 | 代理人: | 刘建芳;杨海霞 |
地址: | 571101 *** | 国省代码: | 海南;66 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 引物 利用 检测 马铃薯 病毒 方法 | ||
1.一种简并引物,其特征在于,由正向引物和反向引物组成,正向引物的核苷酸序列为:5’-GTITGYGTKGAYGAYTTYAAYAA-3’;反向引物的核苷酸序列为:5’-GTRTGBCKYTCIGTRTYYTC-3’;其中,Y=C/T,K=G/T,R=A/G,B=G/T/C,I=次黄嘌呤。
2.利用权利要求1所述简并引物检测马铃薯Y病毒属病毒的方法,其特征在于,包括如下步骤:以样品总RNA为模板,利用上述引物进行Touch-down RT-PCR反应,反应结束后凝胶电泳检测扩增产物,在1600-1800bp位置处出现电泳条带,则判定样品中含有马铃薯Y病毒属病毒。
3.如权利要求2所述利用简并引物检测马铃薯Y病毒属病毒的方法,其特征在于,所述的Touch-down RT-PCR反应包括反转录和Touch-down PCR扩增两个过程。
4.如权利要求3所述利用简并引物检测马铃薯Y病毒属病毒的方法,其特征在于,所述反转录的反应温度为42℃;所述Touch-down PCR扩增时,第一个循环退火温度为55℃,以后每个循环退火温度降低1℃,共进行15个循环,然后用退火温度40℃进行20个循环,延伸温度为72℃。
5.如权利要求4所述利用简并引物检测马铃薯Y病毒属病毒的方法,其特征在于,对扩增的DNA片段进行序列测定后,可鉴定马铃薯Y病毒属病毒的种类。
6.权利要求1所述简并引物应用于马铃薯Y病毒属病毒Touch-down RT-PCR通用检测试剂盒。
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