[发明专利]K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒及检测方法在审

专利信息
申请号: 201310732595.5 申请日: 2013-12-25
公开(公告)号: CN103695555A 公开(公告)日: 2014-04-02
发明(设计)人: 吴舒歌;吴大治;夏懿 申请(专利权)人: 上海星耀医学科技发展有限公司;上海复星医药(集团)股份有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 201315 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: ras 基因 突变 荧光 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,该试剂盒包括PCR混合反应液、等位基因特异性MGB探针、通用上游引物、ARMS下游引物、野生型内标探针及野生型下游引物,以及阳性对照品。

2.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述PCR混合反应液中含PCR Buffer、UNG酶、Taq DNA聚合酶、MgCl2、dNTPs。

3.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述等位基因特异性MGB探针序列如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8所示。

4.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述通用上游引物序列如SEQ ID NO:9所示; 所述ARMS下游引物序列如SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17所示。

5.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述野生型内标探针序列如SEQ ID NO:18所示;所述野生型下游引物序列如SEQ ID NO:19所示。

6.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述等位基因特异性MGB探针包括如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的序列中的一种或多种时,所述阳性对照品是存在密码子12 GGT > GAT和12 GGT > AGT置换突变的混合质粒DNA。

7.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述等位基因特异性MGB探针包括如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的序列中的一种或多种时,所述阳性对照品是存在密码子12 GGT > GTT和12 GGT > GCT置换突变的混合质粒DNA。

8.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述等位基因特异性MGB探针包括如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示的序列中的一种或多种时,所述阳性对照品是存在密码子12 GGT > TGT和12 GGT > CGT置换突变的混合质粒DNA。

9.根据权利要求1所述的人类K-ras基因8种突变荧光分型检测试剂盒,其特征在于:所述等位基因特异性MGB探针包括如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示的序列中的一种或多种时,所述阳性对照品是存在密码子13 GGC > GAC和13 GGC > CGC置换突变的混合质粒DNA。

10.一种人类K-ras基因8种突变荧光分型检测方法,其特征在于:包括以下步骤:按常规方法提取待检测样本的基因组DNA,然后分4个反应管(A、B、C、D)进行检测,首先在每个反应管中分别加入PCR混合反应液、通用上游引物、野生型内标探针及野生型下游引物,然后在反应管A加入检测密码子12 GGT > GAT与12 GGT > AGT置换突变的MGB探针和ARMS下游引物;在反应管B加入检测密码子12 GGT > GTT与12 GGT > GCT置换突变的MGB探针和ARMS下游引物;在反应管C加入检测密码子12 GGT > TGT与12 GGT > CGT置换突变的MGB探针和ARMS下游引物;在反应管D加入检测密码子13 GGC > GAC与13 GGC > CGC置换突变的MGB探针和ARMS下游引物,进行核酸样本的荧光定量PCR检测;

    所述通用上游引物的序列如SEQ ID NO:9所示;

    所述野生型内标探针及野生型下游引物序列如SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19所示;

所述用于检测密码子12 GGT > GAT与12 GGT > AGT置换突变的MGB探针和ARMS下游引物序列如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11所示;

    所述用于检测密码子12 GGT > GTT与12 GGT > GCT置换突变的MGB探针和ARMS下游引物序列如SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13所示;

    所述用于检测密码子12 GGT > TGT与12 GGT > CGT置换突变的MGB探针和ARMS下游引物序列如SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15所示;

所述用于检测密码子13 GGC > GAC与13 GGC > CGC置换突变的MGB探针和ARMS下游引物序列如SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17所示。

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