[发明专利]新型假丝酵母菌RNA提取试剂及其使用方法在审

专利信息
申请号: 201310740305.1 申请日: 2013-12-30
公开(公告)号: CN103695415A 公开(公告)日: 2014-04-02
发明(设计)人: 祁文瑾 申请(专利权)人: 祁文瑾
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12R1/72
代理公司: 北京市振邦律师事务所 11389 代理人: 李朝辉
地址: 650000 云南省昆明市*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 新型 酵母菌 rna 提取 试剂 及其 使用方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及医学分子生物学技术领域,特别涉及一种新型假丝酵母菌RNA提取试剂及其使用方法。

背景技术

假丝酵母菌(Candida Albicans),亦称念珠菌,可侵犯皮肤、粘膜和内脏,表现为急性、亚急性或慢性炎症,大多为继发性感染。假丝酵母菌种类很多,但能对人致病的仅有几种,以白假丝酵母菌(C.albicans)即白色念珠菌最常见,致病力也最强,其次为热带假丝酵母菌(C.tropicalis),其它还有克柔假丝酵母菌(C.krusei)、近平滑假丝酵母菌(C.parapsilokis)和伪热带假丝酵母菌(C.pseudotropicalis)等。

假丝酵母菌的主要特征是细胞呈球形、椭圆形、圆筒形、长条形,有时为不规则形;通过发芽而繁殖,可形成假丝菌,少数形成厚膜孢子及真菌丝。假丝酵母菌为酵母型真菌,芽生酵母在特定条件下转为菌丝后则致病力增强。

对假丝酵母菌RNA提取,然后进行研究,是现代医学技术中非常重要的研究方法与手段,现有技术中,对假丝酵母菌分子生物学水平的研究常常需提取其总RNA,目前常用的假丝酵母菌破壁提取方法有:-80℃研磨破壁法、液氮研磨破壁法、酸洗玻璃珠破壁法、Trizol法、改进Trizol法、超声粉碎法、热酚法及改良的热酚法、反复冻融法等,也有少部分学者使用过蜗牛酶破壁法。在这些方法中,超声波法和玻璃珠漩涡振荡会打断RNA链,形成小分子RNA,不适于后续的分子生物学试验要求。热酸性酚法耗时长,所用试剂多且实验中加入的酚类物质不易除去,最终易与RNA形成褐色复合物而导致RNA完全丧失生物学活性。而氮研磨法、反复冻融法等常用破壁方法虽然效果较好,但操作步骤繁琐,不适于大量样本RNA的提取。与本申请提案最为接近的技术方案为Trizol法,该方法对实验结果影响很大,Trizol法在提取白色念珠菌RNA之前往往无法充分破坏假丝酵母菌细胞壁,使提取出的RNA十分不纯,残存有蛋白质、无机盐离子及大量有机杂质等,需要后续大量的工作才能够进行应用,因而无法获得高质量的总RNA,浪费了大量的人力物力。

发明内容

针对现有技术方法对假丝酵母菌RNA提取影响很大、提取出的RNA残存有蛋白质、无机盐离子及大量有机杂质等上述缺陷和问题,本发明实施例的目的是提供一种可靠性更好的新型假丝酵母菌RNA提取试剂及其使用方法,破壁液破壁充分,对实验结果影响较小,利用离心吸附柱进行RNA的洗涤,可以有效除去蛋白质、无机盐离子及有机杂质等。

为了达到上述目的,本发明实施例提供如下技术方案:

一种新型假丝酵母菌RNA提取试剂,其特征在于,试剂由氯仿,70%乙醇,其中70%乙醇为无RNase去离子水配置而成,山梨醇,乙二胺四乙酸二钠盐/40mL水溶液,沙堡罗培养基,β-巯基乙醇,溶壁酶,异丙醇、Trizol液、RNase-Free水构成。

作为上述技术方案的优选,本发明提供一种新型假丝酵母菌RNA提取试剂的使用方法,其步骤如下所示:

Q1:样品处理步骤:菌株准备:以无菌接种环挑取方式,将保存的纯化菌株,接种于沙堡罗培养基上,37℃过夜培养备用;

Q2:样品处理步骤:细胞悬液:将步骤Q1中得到的37℃过夜培养的相同量白假丝酵母菌菌落,溶于山梨醇、EDTA的混合液体中,使悬液细胞浓度OD600在0.6~1.0范围内;

Q3:将上述Q2步骤中得到的菌悬液置于离心管中,加入β-巯基乙醇和溶壁酶,25℃培养24小时至溶液看起来清亮;

Q4:将上述Q3步骤中得到的清亮溶液置于4℃环境中,以5000转/分钟的速率,离心5分钟,弃上清部分,得到白色细胞团,加入Trizol液,氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15秒,室温放置2分钟;

Q5:将上述Q4步骤中得到的溶液,在4℃环境中,以12,000转/分钟的速率,离心10分钟,将上层水相移到一个新的无RNase离心管中;

Q6:将上述Q5步骤中得到的水相溶液中加入等体积的异丙醇,混匀,静置10分钟,以12,000转/分钟的速率,离心10分钟,弃上清部分;

Q7:将上述Q6步骤中得到的溶液加入到收集管的吸附柱中,以12,000转/分钟的速率,离心20秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中;

Q8:向吸附柱中加入70%乙醇,以12,000转/分钟的速率,离心20秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中;

Q9:重复步骤Q8,然后将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干;

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