[发明专利]检测外周血游离DNA的试剂盒及寡核苷酸有效

专利信息
申请号: 201310741282.6 申请日: 2013-12-27
公开(公告)号: CN103710452A 公开(公告)日: 2014-04-09
发明(设计)人: 朱运峰;张爱群 申请(专利权)人: 朱运峰
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京正理专利代理有限公司 11257 代理人: 赵晓丹
地址: 100071 北京市丰*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 检测 外周血 游离 dna 试剂盒 寡核苷酸
【权利要求书】:

1.一组检测外周血游离DNA的寡核苷酸,其特征在于,由序列表SEQ ID No.1至序列表SEQ ID No.4所示碱基序列的寡核苷酸组成;其中SEQ ID No.1和SEQ ID No.2分别为扩增LINE-1基因的上、下游引物,SEQ ID No.3和SEQ ID No.4分别为扩增Alu基因的上、下游引物。

2.一种检测外周血游离DNA的试剂盒,其特征在于,由以下组分组成:

1)酶切反应液,其包括:HpaII酶,10×buffer;

2)qPCR反应液,其包括:扩增LINE-1基因的上游引物和下游引物,扩增Alu基因的上游引物和下游引物,和含有SYBR Green的PCR反应液;

其中,扩增LINE-1基因的上游引物和下游引物分别是SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的核苷酸序列,扩增Alu基因的上游引物和下游引物分别是SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的核苷酸序列;

3)制备标准曲线的DNA标准品;

4)阴性对照DNA样品;

5)阳性对照DNA样品;

6)ddH2O。

3.一种检测外周血游离DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)抽提外周血游离DNA;

2)使用HpaII酶对外周血游离DNA进行酶切;

3)进行实时荧光PCR定量扩增,其中,使用的引物为序列表SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的扩增LINE-1基因上、下游引物,和序列表SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的扩增Alu基因的上、下游引物;

4)结果判定,按照如下公式计算

(a)血浆游离DNA中Alu的绝对浓度:根据标准曲线测定血浆游离DNA中Alu的绝对浓度;

(b)△Ct=∣(Ct-L1precut–Ct-Aluprecut)∣;

(c)△△Ct=∣(Ct-L1precut–Ct-Aluprecut)—(Ct-L1postcut–Ct-Alupostcut)∣;

其中,血浆游离DNA中Alu的绝对浓度小于2.5ng/ml为阴性;△Ct值大于3.2为阴性;△△Ct值小于0.8为阴性。

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