[发明专利]检测外周血游离DNA的试剂盒及寡核苷酸有效
申请号: | 201310741282.6 | 申请日: | 2013-12-27 |
公开(公告)号: | CN103710452A | 公开(公告)日: | 2014-04-09 |
发明(设计)人: | 朱运峰;张爱群 | 申请(专利权)人: | 朱运峰 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京正理专利代理有限公司 11257 | 代理人: | 赵晓丹 |
地址: | 100071 北京市丰*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 外周血 游离 dna 试剂盒 寡核苷酸 | ||
1.一组检测外周血游离DNA的寡核苷酸,其特征在于,由序列表SEQ ID No.1至序列表SEQ ID No.4所示碱基序列的寡核苷酸组成;其中SEQ ID No.1和SEQ ID No.2分别为扩增LINE-1基因的上、下游引物,SEQ ID No.3和SEQ ID No.4分别为扩增Alu基因的上、下游引物。
2.一种检测外周血游离DNA的试剂盒,其特征在于,由以下组分组成:
1)酶切反应液,其包括:HpaII酶,10×buffer;
2)qPCR反应液,其包括:扩增LINE-1基因的上游引物和下游引物,扩增Alu基因的上游引物和下游引物,和含有SYBR Green的PCR反应液;
其中,扩增LINE-1基因的上游引物和下游引物分别是SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的核苷酸序列,扩增Alu基因的上游引物和下游引物分别是SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的核苷酸序列;
3)制备标准曲线的DNA标准品;
4)阴性对照DNA样品;
5)阳性对照DNA样品;
6)ddH2O。
3.一种检测外周血游离DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)抽提外周血游离DNA;
2)使用HpaII酶对外周血游离DNA进行酶切;
3)进行实时荧光PCR定量扩增,其中,使用的引物为序列表SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的扩增LINE-1基因上、下游引物,和序列表SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的扩增Alu基因的上、下游引物;
4)结果判定,按照如下公式计算
(a)血浆游离DNA中Alu的绝对浓度:根据标准曲线测定血浆游离DNA中Alu的绝对浓度;
(b)△Ct=∣(Ct-L1precut–Ct-Aluprecut)∣;
(c)△△Ct=∣(Ct-L1precut–Ct-Aluprecut)—(Ct-L1postcut–Ct-Alupostcut)∣;
其中,血浆游离DNA中Alu的绝对浓度小于2.5ng/ml为阴性;△Ct值大于3.2为阴性;△△Ct值小于0.8为阴性。
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