[发明专利]发现治疗靶标的方法

权利要求书

1.一种筛选治疗靶标的方法，所述方法包括：

a.使肽阵列与来自具有感兴趣的已知状况的个体的第一生物样品接触；

b.检测所述第一生物样品中的抗体与所述肽阵列的结合以获得第一免疫特征谱；

c.使肽阵列与来源于没有已知状况的个体的对照样品接触；

d.检测所述对照样品中的抗体与所述肽阵列的结合以获得第二免疫特征谱；

e.将所述第一免疫特征谱与所述第二免疫特征谱进行比较，并鉴定与所述第二免疫特征谱相比在所述第一免疫特征谱中结合更少或更多抗体的差异结合的肽；以及

f.将与所鉴定的差异结合的肽相对应的蛋白质鉴定为针对所述感兴趣的状况的治疗靶标。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述蛋白质未经注释。

3.如权利要求1所述的方法，其中所述蛋白质具有移码。

4.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗靶标为所述蛋白质的表位。

5.如权利要求1所述的方法，其中所述肽阵列包含至少10,000个不同的肽。

6.如权利要求1所述的方法，其中所述肽阵列包含至少100,000个不同的肽。

7.如权利要求1所述的方法，其中所述肽阵列包含至少330,000个不同的肽。

8.如权利要求1所述的方法，其中所述肽阵列包含至少500,000个不同的肽。

9.如权利要求5-8中任一项所述的方法，其中所述肽阵列上的不同的肽为8至35个残基的长度。

10.如权利要求5-9中任一项所述的方法，其中所述肽阵列上的不同的肽具有范围为2-4nm的平均间距。

11.如权利要求5-10中任一项所述的方法，其中所述肽阵列上的不同的肽具有范围为3-6nm的平均间距。

12.如权利要求5-11中任一项所述的方法，其中所述不同的肽包含肽模拟物。

13.如权利要求5-12中任一项所述的方法，其中所述不同的肽具有随机氨基酸序列。

14.如权利要求5-13中任一项所述的方法，其中所述不同的肽包含非天然氨基酸。

15.如权利要求1-14中任一项所述的方法，其进一步包括开发针对所述治疗靶标的疫苗。

16.一种鉴定疫苗靶标的方法，所述方法包括：

a.使肽阵列与来自具有感兴趣的已知状况的个体的第一生物样品接触；

b.检测所述第一生物样品中的抗体与所述肽阵列的结合以获得第一免疫特征谱；

c.使肽阵列与来源于没有已知状况的个体的对照样品接触；

d.检测所述对照样品中的抗体与所述肽阵列的结合以获得第二免疫特征谱；

e.将所述第一免疫特征谱与所述第二免疫特征谱进行比较，并鉴定与所述第二免疫特征谱相比在所述第一免疫特征谱中结合更少或更多抗体的差异结合的肽；以及

f.将与所鉴定的差异结合的肽相对应的蛋白质鉴定为针对所述感兴趣的状况的疫苗靶标。

17.如权利要求16所述的方法，其中所述蛋白质未经注释。

18.如权利要求16所述的方法，其中所述蛋白质具有移码。

19.如权利要求16所述的方法，其中所述治疗靶标为所述蛋白质的表位。

20.如权利要求16所述的方法，其中所述肽阵列包含至少10,000个不同的肽。

21.如权利要求16所述的方法，其中所述肽阵列包含至少100,000个不同的肽。

22.如权利要求16所述的方法，其中所述肽阵列包含至少330,000个不同的肽。

23.如权利要求16所述的方法，其中所述肽阵列包含至少500,000个不同的肽。

24.如权利要求20-23中任一项所述的方法，其中所述肽阵列上的不同的肽为8至35个残基的长度。

25.如权利要求20-24中任一项所述的方法，其中所述肽阵列上的不同的肽具有范围为2-4nm的平均间距。