[发明专利]西瓜雌性系基因ClWIP1与染色体易位及连锁标记有效
申请号: | 201410024176.0 | 申请日: | 2014-01-20 |
公开(公告)号: | CN103937785A | 公开(公告)日: | 2014-07-23 |
发明(设计)人: | 许勇;纪高洁;张洁;宫国义;张海英;郭绍贵;任毅 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/29;C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京国林贸知识产权代理有限公司 11001 | 代理人: | 李桂玲;许文娟 |
地址: | 100097 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 西瓜 雌性 基因 clwip1 染色体 易位 连锁 标记 | ||
1.与西瓜雌性系基因ClWIP1连锁的分子标记,其特征在于:其具有序列表中SEQ ID NO:1-6所述的DNA序列。
2.西瓜雌性系基因ClWIP1的DNA序列,其特征在于:其DNA序列全长具有序列表中SEQ ID NO:7所述的DNA序列。
3.导致西瓜雌性系出现的染色体易位区段,其特征在于:野生型材料XHBMB的2号染色体(Chr.2)末端1065957bp(Chr.2:33348296..34414252)的DNA序列,和3号染色体(Chr.3)前端4043236bp(Chr.3:1..4043236)的DNA序列。
4.根据权利要求3所述的导致西瓜雌性系出现的染色体易位区段,其特征在于:该染色体异位区段为:
染色体易位后Chr.23的易位断点位置,即西瓜雌性系材料的Chr.2的易位断点位置,具有序列表SEQ ID NO:8所述的DNA序列;
染色体易位前Chr.2的以为断点位置,具有序列表SEQ ID NO:9所述的DNA序列;
染色体易位后Chr.32的易位断点位置,即西瓜雌性系材料的Chr.2的易位断点位置,具有序列表SEQ ID NO:10所述的DNA序列;
染色体易位前Chr.2的易位断点位置,具有序列表SEQ ID NO:11所述的DNA序列。
5.根据权利要求1所述的与西瓜雌性系基因ClWIP1连锁的分子标记的获得方法,其特征在于,包括如下步骤:
基因定位所用供试材料选取:
所述的基因定位所用供试材料包括:父本AKKZW,母本XHBFGM,,,以二者为亲本进行杂交获取的F1代,该F1代与母本XHBFGM杂交获得BC1代群体{(AKKZW×XHBFGM)F1×XHBFGM}。
基因组DNA的提取:
将所述的AKKZW、XHBFGM、F1代、BC1代群体{(AKKZW×XHBFGM)F1×XHBFGM}分别进行DNA提取处理,得到供试材料基因组DNA;
gy基因的基因组定位:
根据西瓜全基因组测序及重测序结果,对所述的XHBFGM、AKKZW进行全基因组序列比对,获取AKKZW与XHBFGM间的SNP/InDel位点,设计SNP/InDel标记引物作为基因组定位的标记;
采用集团混合分析法,利用所述的SNP/InDel标记引物在所述的AKKZW、XHBFGM、以二者为亲本进行杂交获取的F1代、BC1代群体{(AKKZW×XHBFGM)F1×XHBFGM}进行基因定位,得到所述的与西瓜雌性系基因ClWIP1连锁的分子标记。
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