[发明专利]一种烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法有效
申请号: | 201410034604.8 | 申请日: | 2014-01-25 |
公开(公告)号: | CN103740865A | 公开(公告)日: | 2014-04-23 |
发明(设计)人: | 秦西云;丁铭;卢训;张仲凯;方敦煌;李婷婷;方琦 | 申请(专利权)人: | 云南省烟草农业科学研究院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94 |
代理公司: | 昆明知道专利事务所(特殊普通合伙企业) 53116 | 代理人: | 姜开侠 |
地址: | 650031*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 烟草 花叶 病毒 快速 灵敏 检测 方法 | ||
1.一种烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于包括前处理、PCR反应、电泳检测步骤,具体包括:
A、前处理:待测样品与DEPC处理的PBST溶液混合后进行研磨,离心后取上清液备用;根据GenBank序列数据库中烟草花叶病毒序列,选择单一病毒中较为保守的区域设计引物,不同病毒间试验优化不同引物对间的影响筛选用于复合PCR的不同病毒检测引物对,在PCR管中加入用DEPC溶液稀释的病毒特异性抗体,混合抗体包被于无RNA酶及DNA酶的PCR管备用;取上清液50μl加入PCR管中,36~38℃放置0.5~1.5h以捕捉或沉淀对应的病毒粒子,吸出PCR管中液体,用经DEPC处理的PBST溶液洗涤PCR管内壁2~4次,吸出PCR管中液体,再用DEPC处理水洗涤1~2次PCR管内壁,吸出PCR管中液体,离心,吸净PCR管中液体,PCR管3~5℃放置待用;
B、PCR反应:在PCR管中以病毒RNA作为模板,利用9个单核苷酸碱基的随机引物进行逆转录反应,合成cDNA链,应用烟草花叶病毒引物对进行复合PCR反应;
C、电泳检测:取反应液进行琼脂糖凝胶电泳检测。
2.根据权利要求1所述的烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于所述的烟草花叶型病毒为烟草花叶病毒、黄瓜花叶病毒和/或烟草脉带花叶病毒。
3.根据权利要求1所述的烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于A步骤中所述的混合抗体包被为在PCR管中加入终浓度分别为1:10000、1:5000和1:5000的烟草花叶病毒、黄瓜花叶病毒、烟草脉带花叶病毒多抗稀释液100μl,3~5℃包被过夜或36~38℃包被0.5~1.5h后,吸出PCR管中液体,用经DEPC处理的PBST溶液洗涤PCR内壁1~3次,吸进管中液体,PCR管待用。
4.根据权利要求1或3所述的烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于所述的DEPC处理的PBST溶液为含有0.01%吐温20的0.1mol/L、pH7.0的磷酸盐缓冲液中加入0.2%DEPC充分混匀后放置过夜,高压灭菌30min得到。
5.根据权利要求1所述的烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于A步骤中所述的待测样品与DEPC处理的PBST溶液的重量比为1:5~10。
6.根据权利要求1所述的烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于A步骤中所述的DEPC处理水为超纯水中加入0.2%DEPC充分混匀后放置过夜,121℃高温高压灭菌30min得到。
7.根据权利要求1所述的烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于A步骤中所述的离心转速为5000 ~10000r/min,离心5~10min。
8.根据权利要求1所述的烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于B步骤所述的RNA模板为高温变性法、沉淀法、抗体捕获法获得。
9.根据权利要求1所述烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于B步骤所述的烟草花叶病毒引物对为:
。
10.根据权利要求1所述烟草花叶型病毒的快速灵敏检测方法,其特征在于所述的PCR反应的体系为50 μL,其中10 倍Taq酶缓冲液5 μL、10 mmol/L 浓度的6种引物各1 μL、2.5 mmol/L dNTPs 3 μL、Taq酶 1 μL、灭菌超纯水15 μL;反应条件为94℃预变性4min;94℃变性1min, 58℃退火30s,72℃延伸1min,30个循环;最后72℃延伸10 min。
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