[发明专利]预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测法及试剂盒在审
申请号: | 201410034797.7 | 申请日: | 2014-01-25 |
公开(公告)号: | CN103805699A | 公开(公告)日: | 2014-05-21 |
发明(设计)人: | 王凯;赵静;王丽媛;孙丰凯;高帅;范玉琛;范晓鹏 | 申请(专利权)人: | 山东大学齐鲁医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 济南鲁科专利代理有限公司 37214 | 代理人: | 周长义;崔民海 |
地址: | 250012 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 预测 衰竭 预后 gstp1 甲基化 定量 检测 试剂盒 | ||
1.预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测试剂盒,其特征在于:该试剂盒含有提取待测样本基因组DNA的试剂、重亚硫酸盐修饰基因组DNA的试剂、5×预混PCR反应体系、标准品、阳性对照、阴性对照以及针对目的基因GSTP1启动子的甲基化特异性引物对和内参基因ALU-C4的特异性引物对与相应的Taqman荧光探针,具体序列如下:
GSTP1-上游引物:5’TTCGGGGTGTAGCGGTCGTC 3’;
GSTP1-下游引物:5’GCCCCAATACTAAATCACGACG 3’;
GSTP1-探针: 5’Fam AAATCCCGCGAACTCCCGCC 3’BHQ1;
ALU-C4-上游引物:5’GGTTAGGTATAGTGGTTTATATTTGTAATTTTAGTA 3’;
ALU-C4-下游引物:5’ATTAACTAAACTAATCTTAAACTCCTAACCTCA 3’;
ALU-C4-探针: 5’Fam CCTACCTTAACCTCCC 3’BHQ1。
2.根据权利要求1所述的预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测试剂盒,其特征在于:5×预混PCR反应体系,包含热启动Taq聚合酶、三磷酸脱氧核糖核苷、氯化镁、反应缓冲液、PCR反应的增强剂、优化剂以及稳定剂。
3.根据权利要求1所述的预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测试剂盒,其特征在于:标准品为含目的基因片段的质粒。
4.根据权利要求1所述的预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测试剂盒,其特征在于:阳性对照为重亚硫酸盐修饰的100%甲基化的人基因组DNA。
5.根据权利要求1所述的预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测试剂盒,其特征在于:阴性对照为双蒸馏水。
6.预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测法,其特征在于:采集待测样
本清晨空腹外周血;提取待测样本外周血基因组DNA;重亚硫酸盐修饰基因组DNA;定量检测GSTP1基因启动子甲基化程度:利用目的基因GSTP1启动子的甲基化特异性引物对和内参基因ALU-C4的特异性引物对与相应的Taqman荧光探针,对重亚硫酸盐处理过的基因组DNA进行实时荧光定量聚合酶链式(PCR)反应;根据标准品的扩增结果制备标准曲线;根据目的基因GSTP1和内参基因ALU-C4的阈值循环值,得到待测样本中GSTP1基因启动子甲基化程度的定量值。
7.根据权利要求6所述的预测肝衰竭预后的GSTP1甲基化定量检测法,其特征在于:待测样本GSTP1基因启动子甲基化程度的计算方法为:甲基化率=100%×2 exp-[ΔCp(样品GSTP1 Cp值-样品ALU-C4 Cp值)- ΔCp(阳性对照GSTP1 Cp值-阳性对照ALU-C4 Cp值)]。
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