[发明专利]鸡外周血单核淋巴细胞PD-1重组质粒的构建、基因丰度实时检测方法及其应用无效
申请号: | 201410037329.5 | 申请日: | 2014-01-26 |
公开(公告)号: | CN103789432A | 公开(公告)日: | 2014-05-14 |
发明(设计)人: | 王选年;孙国鹏;王爱国;朱艳平;张艳芳;岳锋;李鹏;张万方;李博文;杨媛;阮涛;王军;李鹏 | 申请(专利权)人: | 新乡学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/63;C12N15/66 |
代理公司: | 郑州市华翔专利代理事务所(普通合伙) 41122 | 代理人: | 张爱军 |
地址: | 453003 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鸡外周血 单核 淋巴细胞 pd 重组 质粒 构建 基因 实时 检测 方法 及其 应用 | ||
1.鸡外周血单核淋巴细胞PD-1实时荧光定量PCR阳性标准重组质粒的构建方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:
采集雏鸡的外周血,分离出淋巴细胞,提取淋巴细胞的总RNA,将总RNA反转录成cDNA,将cDNA保存于-20℃,备用;采用普通PCR方法扩增PD-1目的基因片段,将该目的基因片段经琼脂糖凝胶电泳检测,并回收纯化,然后将PD-1目的基因纯化片段与pMD 18-T载体连接,转化至感受态细胞DH5α中,提取重组质粒,经克隆筛选后进行测序分析,得到与目的基因片段相同序列的阳性标准重组质粒;
普通PCR扩增时的反应体系为25μL,反应体系如下:2μL样品cDNA模板,2.5μL 10×PCR Buffer,2μL dNTP,浓度均为20μmol/L的正向引物和反向引物各0.5μL,0.5μL的TaqDNA 聚合酶,其余为无菌三蒸水;
其中,正向引物F为:5′-GGACTACGGTGTGCTGGAGTT-3′,
反向引物R为:5′-TCTTTCCTCGCTCTGGTGTG-3′。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于:所述目的基因片段为序列表中的SEQ ID No.1序列。
3.根据权利要求1或2所述的构建方法,其特征在于:其中普通PCR扩增时的反应程序为:95℃热启动1min;94℃变性30s;55℃退火30s;72℃延伸30s,30个循环,最后72℃延伸10min。
4.一种鸡外周血单核淋巴细胞PD-1基因的丰度实时检测方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:
(1)将回收纯化的PD-1目的基因片段与pMD 18-T载体连接,然后转化至感受态细胞DH5α中,提取重组质粒;经克隆筛选后进行测序分析,选取与PD-1目的基因片段相同序列的阳性质粒作为标准品质粒,测定标准品质粒的DNA浓度,并换算成质粒的拷贝浓度,按1:10倍的浓度梯度稀释阳性质粒;
(2)以稀释的阳性质粒为模板,进行实时荧光定量PCR扩增反应,用实时荧光定量PCR仪检测荧光信号,反应结束后绘制出标准曲线,然后根据荧光信号的变化及标准曲线测出样品DNA中PD-1的基因丰度;
其中实时荧光定量PCR扩增的反应体系为20μL,包括2μL质粒模板,浓度均为20μmol/L的正向引物F和反向引物R各0.2μL,SYBR Green I PreMix 10μL,三蒸水7.6 μL;
其中,正向引物F为:5′-GGACTACGGTGTGCTGGAGTT-3′,
反向引物R为:5′-TCTTTCCTCGCTCTGGTGTG-3′。
5.根据权利要求4所述的丰度实时检测方法,其特征在于:所述目的基因片段为序列表的SEQ ID No.1序列。
6.根据权利要求4所述的丰度实时检测方法,其特征在于:实时荧光定量 PCR反应程序为:95℃热启动 30s;94℃变性5s;60℃退火和延伸34s,60℃时收集荧光信号,再40个循环。
7.根据权利要求4所述的丰度实时检测方法,其特征在于:实时荧光定量PCR反应时采用的实时荧光定量PCR仪为ABI 7500 Fast型荧光定量PCR仪。
8.根据权利要求4-7任一项所述的丰度实时检测方法,其特征在于:所述稀释的阳性质粒浓度范围为4.36×1010-4.36×101 copies/μL;所述标准曲线的相关系数R2=1.0,斜率为-3.484。
9.权利要求4-7任一项所述的检测方法在分析鸡感染免疫抑制性疾病后PD-1基因的转录水平变化规律中的应用。
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