[发明专利]一种shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体、重组质粒及其构建方法在审
申请号: | 201410040531.3 | 申请日: | 2014-01-27 |
公开(公告)号: | CN104805120A | 公开(公告)日: | 2015-07-29 |
发明(设计)人: | 苟德明;康康;何洁凝;李洁璇;田生礼 | 申请(专利权)人: | 苟德明;康康 |
主分类号: | C12N15/867 | 分类号: | C12N15/867;C12N15/66 |
代理公司: | 广州番禺容大专利代理事务所(普通合伙) 44326 | 代理人: | 刘新年 |
地址: | 518060 广东省深圳市南*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 shrna ago2 表达 病毒 rnai 载体 重组 质粒 及其 构建 方法 | ||
1.一种shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体,其特征在于,所述RNAi载体包含shRNA表达框和Ago2蛋白表达框;所述shRNA表达框包含启动子hU6、H1或7SK,以及ccdB致死基因;所述Ago2蛋白表达框包含CMV启动子、Ago2蛋白表达基因、内部核糖体进入位点DNA序列和ZsGreen1绿色荧光蛋白表达基因。
2.根据权利要求1所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体,其特征在于,所述的ccdB致死基因的两端设有限制性酶切位点BamHI和MluI。
3.权利要求1-2任一项所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)制备用于构建载体的骨架pLVX-IRES-ZsGreen1-Puro:
以pLVX-IRES-ZsGreen1载体为模板,扩增得到IRES-ZsGreen1片段,用Cla1-Xba1双酶切PCR产物,然后通过相应的位点克隆到pLVX-Puro载体,得到pLVX-IRES-ZsGreen1-Puro载体骨架。
(2)插入增强因子Ago2基因表达框CMV-Ago2:
用MluI和EcoRI双酶切pIRESneo-FLAG/HA-Ago2载体,得到CMV-Ago2片段,将CMV-Ago2片段与步骤(1)回收的pLVX-IRES-ZsGreen1-Puro载体骨架连接,转入大肠杆菌感受态细胞,涂LB平板,培养过夜,进行菌落PCR及酶切鉴定,得到的载体pLVX-CMV-Ago2-IRES-ZsGreen1-Puro;
(3)插入shRNA表达启动子
用BclI和MluI双酶切步骤(2)得到的载体pLVX-CMV-Ago2-IRES-ZsGreen1-Puro,去磷酸后电泳回收;用BclI和MluI双酶切扩增hU6、H1或7SK启动子的PCR产物后,连接到pLVX-CMV-Ago2-IRES-ZsGreen1-Puro载体的相应位点上,转入大肠杆菌感受态细胞中,涂LB平板,培养过夜,鉴定后得到的载体为:pLVX-hU6/H1/7SK-CMV-Ago2-IRES-ZsGreen1-Puro。
(4)插入ccdB序列得到shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体:
从pLenti6载体扩增含有大肠杆菌ccdB致死基因的片段,用BamHI和Mlu I双酶切后与经BamHI和Mlu I双酶切的pLVX-hU6/H1/7SK-CMV-Ago2-IRES-ZsGreen1-Puro载体连接,转入大肠杆菌感受态细胞中,涂LB/amp+Chl双抗平板,培养过夜,进行菌落PCR及酶切鉴定,得到shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体,载体骨架是pLVX-hU6/H1/7SK-ccdB-CMV-Ago2-IRES-ZsGreen1-Puro。
4.一种shRNA-Ago2共表达慢病毒重组质粒,其特征在于,包含权利要求1-2任一项所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体。
5.根据权利要求4所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒重组质粒,其特征在于,还包含目的基因shRNA,所述shRNA的茎部长度为19~22bp,所述shRNA的loop长度是4~9bp。
6.根据权利要求5所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒重组质粒,其特征在于,所述shRNA的茎部长度为20bp。
7.根据权利要求5所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒重组质粒,其特征在于,所述shRNA的loop长度是6~9bp。
8.根据权利要求5所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒重组质粒,其特征在于,所述shRNA的sense/antisense结构是从5’端开始的sense-loop-antisense结构。
9.权利要求4或5所述的shRNA-Ago2共表达慢病毒重组质粒的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)针对目的基因设计shRNA编码序列,化学合成两条引物,将两条引物退火形成带限制性内切酶BamHI和MluI黏性末端的shRNA;
2)通过限制性内切酶BamHI和MluI消化shRNA-Ago2共表达慢病毒RNAi载体骨架,酶切回收后,将载体骨架与退火的shRNA进行连接,转化大肠杆菌感受态细胞并涂板培养过夜;
3)将平板上长出的单克隆菌落进行DNA测序,确定shRNA编码序列的正确插入,得到shRNA-Ago2共表达慢病毒重组质粒。
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