[发明专利]一种TALE聚体库的构建方法无效
申请号: | 201410045243.7 | 申请日: | 2014-02-07 |
公开(公告)号: | CN103789840A | 公开(公告)日: | 2014-05-14 |
发明(设计)人: | 王文忠;施金秀;张玮;蒙伟能;李春园;温华杰 | 申请(专利权)人: | 赛业(广州)生物科技有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C40B40/02;C12N15/70;C12N15/66 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 510663 广东省广州市科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 tale 聚体库 构建 方法 | ||
1.一种TALE聚体库的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)TALE单体扩增:分别以pTALE-NI,pTALE-NG,pTALE-NH,pTALE-HD载体为模板,使用引物对TALE-Fn/TALE-Rn进行扩增,分别得到第一类至第十五类单体的混合物和第十六类单体N16,其中,所述n为1至16;
(2)构建酶切连接产物:分别将所述第一类至第十五类单体进行酶切和连接,得到第一至第八酶切连接产物;
(3)酶切连接产物扩增:分别以所述第一至第八酶切连接产物和第十六类单体N16为模板,使用引物对attB1-F/attB1-R进行扩增,分别得到第一类至第六类五聚体混合物、三聚体混合物、二聚体混合物和第十六类单体N16扩增产物;
(4)TALE聚体克隆:分别将所述第一类、第二类、第三类、第四类、第五类、第六类五聚体混合物、三聚体、二聚体混合物以及第十六类单体N16扩增产物,与pDonr221载体(Kana+)进行BP反应,将BP反应产物进行转化并进行测序;
(5)TALE聚体库构建:根据确定的五聚体、三聚体、二聚体和单体序列信息,得到第一类至第五类五聚体库、三聚体库、二聚体库和单体库。
2.根据权利要求1所述的TALE聚体库的构建方法,其特征在于,所述TALE单体扩增包括如下步骤:
分别以pTALE-NI,pTALE-NG,pTALE-NH,pTALE-HD为模板,
使用引物对TALE-F1/TALE-R1,进行扩增,得到第一类单体的混合物,即NI1,NG1,NH1和HD1;
使用TALE-F2/TALE-R2引物对进行扩增,得到第二类单体的混合物,即NI2,NG2,NH2和HD2;
使用TALE-F3/TALE-R3引物对进行扩增,得到第三类单体的混合物,即NI3,NG3,NH3和HD3;
使用TALE-F4/TALE-R4引物对进行扩增,得到第四类单体的混合物,即NI4,NG4,NH4和HD4;
使用TALE-F5/TALE-R5引物对进行扩增,得到第五类单体的混合物,即NI5,NG5,NH5和HD5;
使用TALE-F6/TALE-R1引物对进行扩增,得到第六类单体的混合物,即NI6,NG6,NH6和HD6;
使用TALE-F5/TALE-R7引物对进行扩增,得到第七类单体的混合物,即NI7,NG7,NH7和HD7;
使用TALE-F8/TALE-R1引物对进行扩增,得到第八类单体的混合物,即NI8,NG8,NH8和HD8;
使用TALE-F5/TALE-R9引物对进行扩增,得到第九类单体的混合物,即NI9,NG9,NH9和HD9;
使用TALE-F10/TALE-R1引物对进行扩增,得到第十类单体的混合物,即NI10,NG10,NH10和HD10;
使用TALE-F5/TALE-R11引物对进行扩增,得到第十一类单体的混合物,即NI11,NG11,NH11和HD11;
使用TALE-F12/TALE-R1引物对进行扩增,得到第十二类单体的混合物,即NI12,NG12,NH12和HD12;
使用TALE-F5/TALE-R13引物对进行扩增,得到第十三类单体的混合物,即NI13,NG13,NH13和HD13;
使用TALE-F3/TALE-R13引物对进行扩增,得到第十四类单体的混合物,即NI14,NG14,NH14和HD14;
使用TALE-F2/TALE-R13引物对进行扩增,得到第十五类单体的混合物,即NI15,NG15,NH15和HD15;
使用TALE-F1/TALE-R13引物对进行扩增,得到第十六类单体,即单体NI16,NG16,NH16和HD16,命名为N16。
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