[发明专利]一种同管检测HTLV-I和HTLV-II前病毒的引物和方法有效
申请号: | 201410084487.6 | 申请日: | 2014-03-10 |
公开(公告)号: | CN103898239A | 公开(公告)日: | 2014-07-02 |
发明(设计)人: | 陈奕磊;黎洪奋;王淑一 | 申请(专利权)人: | 上海艾迪康医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 黎双华 |
地址: | 200237 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 htlv ii 病毒 引物 方法 | ||
1.一种用于检测HTLV-I和HTLV-II前病毒的引物,包括检测HTLV-I前病毒的特异性引物(SEQ NO1和SEQ NO2)及探针(SEQ NO3)和检测HTLV-II前病毒的特异性引物(SEQ NO4和SEQ NO5)及探针(SEQ NO6),其中:
(i) 检测HTLV-I前病毒的特异性引物及探针:
SEQ NO1:CCCATTGGCTCCTGTGAAAG;
SEQ NO2:TTGAGACAGCGCCACGAAC;
SEQ NO3:JOE-TCTCGGACTTTTGCATGGCCTCTCC-TAMARA
(ii) 检测HTLV-II前病毒的特异性引物及探针:
SEQ NO4:TTGCCATACCTGTCAAACCATC;
SEQ NO5:CTGAAGAACGGCGCTGATAGTC;
SEQ NO6:FAM-CTTCTCCGGTGCGGTTTCCGTCT-TAMARA。
2.根据权利要求1所述的引物,其特征在于,在检测HTLV-I和HTLV-II前病毒时,所述的引物同时被使用,并被放置在同一个反应管中。
3.根据权利要求1所述的引物,其特征在于,在总反应体积为25ul时,引物和探针的使用量为:引物SEQ NO1、SEQ NO 2、SEQ NO4、SEQ NO 5各0.6ul、探针SEQ NO3和SEQ NO 6各0.3 ul。
4.根据权利要求1所述的引物,其特征在于,所述的引物参与的反应程序为95℃ 5min预变性;95℃ 15s,59℃ 35s循环40次。
5.一种同管检测HTLV-I和HTLV-II前病毒的方法,其特征在于包括:
(1)提取样本中的DNA;
(2)以步骤(1)中的DNA作为模板,在同一PCR管同时加入检测HTLV-I前病毒的引物及探针和检测HTLV-II前病毒的引物及探针,并通过Real-time PCR反应对样本进行检测,其中:
(i) 检测HTLV-I前病毒的特异性引物及探针:
SEQ NO1:CCCATTGGCTCCTGTGAAAG;
SEQ NO2:TTGAGACAGCGCCACGAAC;
SEQ NO3:JOE-TCTCGGACTTTTGCATGGCCTCTCC-TAMARA
(ii) 检测HTLV-II前病毒的特异性引物及探针:
SEQ NO4:TTGCCATACCTGTCAAACCATC;
SEQ NO5:CTGAAGAACGGCGCTGATAGTC;
SEQ NO6:FAM-CTTCTCCGGTGCGGTTTCCGTCT-TAMARA;
(3) 根据结果来分析样本是否感染HTLV病毒。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,Real-time PCR的反应体系为25ul,包括2*qPCR MIX 12.5ul、引物SEQ NO1、SEQ NO 2、SEQ NO4、SEQ NO 5各0.6ul、探针SEQ NO3和SEQ NO 6各0.3 ul、灭菌水7.5ul、DNA模板2 ul。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,Real-time PCR反应程序为:95℃ 5min预变性;95℃ 15s,59℃ 35s循环40次。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,对检测结果分析包括:若样本产生一条扩增曲线,且CT值≤38,则样本为HTLV阳性,且根据相对应的探针,可判断样本所感染的HTLV基因型;若样本未产生扩增曲线,则判定样本为阴性。
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