[发明专利]检测血液中弓形虫感染的双重荧光定量PCR方法及其特异引物无效
申请号: | 201410087454.7 | 申请日: | 2014-03-11 |
公开(公告)号: | CN103952471A | 公开(公告)日: | 2014-07-30 |
发明(设计)人: | 黄翠琴;王寿昆;赵东岳;郑新添 | 申请(专利权)人: | 龙岩学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 福州君诚知识产权代理有限公司 35211 | 代理人: | 戴雨君 |
地址: | 364000 福建省龙岩市新罗*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 血液 弓形虫 感染 双重 荧光 定量 pcr 方法 及其 特异 引物 | ||
1.两种检测弓形虫感染的特异引物对,其特征在于:
利用 ITS-1序列设计第一种特异引物对,所述第一种特异引物对为:
上游:5′-ACAGCGAAGGGGCTCAAT-3′;
下游:5′-AGCAATCTGAAAGCACATCG-3′;
利用529bp序列设计第二种特异引物对,所述第二种特异引物对为:
上游:5′-AGCCACAGAAGGGACAGAAGT-3′;
下游:5′-GTCTCTTTTTCCACCCTCCAG-3′。
2.采用权利要求 1所述的两种特异引物对检测血液中弓形虫感染的双重荧光定量PCR方法,其特征在于:所述双重荧光定量PCR方法包括以下步骤:
1)提取弓形虫RH株的基因组模板;
2)利用两种特异引物对分别进行Touch-down PCR扩增;
3)分别回收步骤2)扩增的目的片段,将其连接到PUM-T载体并转化到大肠杆菌中;在36-38℃、100-200rpm/min条件下将大肠杆菌摇培过夜,用质粒回收试剂盒提取经过夜培养的大肠杆菌菌液,即得到两种重组质粒,分别对两种重组质粒进行基因测序,得到重组质粒PUM-T-ITS-1和PUM-T-529bp ;
4)标准曲线的建立,将步骤3)获得的PUM-T-ITS-1和PUM-T-529bp重组质粒作为标准品,经紫外分光光度计测定两种标准品的OD260值,经以下公式计算得到标准品的拷贝数:
质粒拷贝数=质粒浓度×阿氏常数/质粒的分子量
5)标准曲线的绘制,将获得的两种标准品分别稀释成不同梯度浓度,作为模板进行荧光定量PCR反应,反应完成后,得出每个拷贝数所对应的CT值,以标准品拷贝数的对数值为横坐标,测得的每个拷贝数所对应的CT值为纵坐标,以PUM-T-ITS-1和PUM-T-529bp作为标准品分别作标准曲线;
6)溶解曲线的绘制,取步骤1)提取的RH株弓形虫DNA作为模板,分别对两种特异引物对进行双重荧光定量PCR反应;对反应后产物采用ABI 7500 software v2.0.5进行分析。
3.根据权利要求2所述的检测血液中弓形虫感染的双重荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤6)的双重荧光定量PCR反应,其反应条件为:95℃, 30S;95℃ ,5S;60℃,30S;40个循环。
4.根据权利要求2所述的检测血液中弓形虫感染的双重荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤6)的双重荧光定量PCR反应,
其反应体系为:SYBR Premix Dimer Eraser(2×) 10μL,荧光定量PCR上下游引物混匀后各取0.3μL(0.2μL -0.5μL),ROXⅡ0.4μL,补充灭菌水至反应总体系为20μL。
5.根据权利要求2所述的检测血液中弓形虫感染的双重荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤6)溶解曲线的绘制时,双重荧光定量PCR反应条件为:95℃,15S; 60℃,1min; 95℃,30S。
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