[发明专利]一种真菌菌丝总DNA的提取方法在审

专利信息
申请号: 201410102771.1 申请日: 2014-03-19
公开(公告)号: CN103820434A 公开(公告)日: 2014-05-28
发明(设计)人: 李小林;郑林用;李昕竺;曾先富;黄羽佳 申请(专利权)人: 四川省农业科学院土壤肥料研究所;成都市农林科学院;四川省技术创新促进会
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12R1/645
代理公司: 成都虹桥专利事务所(普通合伙) 51124 代理人: 高芸;梁鑫
地址: 610066 四川省成都市锦江区*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 真菌 菌丝 dna 提取 方法
【权利要求书】:

1.真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:包括如下步骤:

(1)收集真菌菌丝体;

(2)真菌菌丝体置于DNA提取液中,捣碎真菌菌丝体;

(3)在-70℃至-85℃的低温环境与60-65℃水浴环境中反复冻融2~3次;

(4)加入蛋白酶K和溶菌酶处理;

(5)去酶及纯化DNA。

2.根据权利要求1所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(2)所述DNA提取液各组分浓度为:80-120mmol/LTris-HCl,80-120mmol/L乙二胺四乙酸,80-120mmol/L磷酸钠,1.0-1.5mol/L氯化钠,0.8-1%(g/g)十六烷基三甲基溴化铵,pH值=7.8-8.2,溶剂为无菌蒸馏水;优选溶剂为灭菌双蒸水。

3.根据权利要求2所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(2)DNA提取液的各组分浓度为:100mmol/LTris-HCl,100mmol/L乙二胺四乙酸,100mmol/L磷酸钠,1.5mol/L氯化钠,1%(g/g)十六烷基三甲基溴化铵,pH值=8.0,溶剂为无菌蒸馏水;优选溶剂为灭菌双蒸水。

4.根据权利要求1-3任一项所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(2)DNA提取液的添加量为:每1g真菌菌丝体添加DNA提取液1-1.6ml,优选1.5ml。

5.根据权利要求1所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(3)所述的具体条件是:在-70℃至-85℃的低温环境放置5-10min,再在60-65℃水浴环境中放置15-20min,如此反复冻融2~3次。

6.根据权利要求5所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(3)所述的具体条件是:在-80℃的低温环境放置5-10min,再在65℃水浴环境中放置20min,如此反复冻融2~3次。

7.根据权利要求1所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(4)所述蛋白酶K和溶菌酶的添加量为:

按1g菌丝量计算,加入8-12mg/mL蛋白酶K40-60μL,80-120mg/ml溶菌酶40-60μL,涡旋混匀后,于37℃的环境,在150-200r/min的条件下振荡15-30min。

8.根据权利要求7所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(4)所述蛋白酶K和溶菌酶的添加量为:

按1g菌丝量计算,加入10mg/mL蛋白酶K50μL,100mg/ml溶菌酶50μL,涡旋混匀后,于37℃的环境,在200r/min的条件下振荡30min。

9.根据权利要求1所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(5)去酶及纯化DNA包括如下步骤:

A、加入20%(g/g)十二烷基硫酸钠溶液180-230μL,涡旋混匀后水浴,水浴条件:58-63℃、1.5-2.0h,期间每10-30min振荡1次;

B、室温条件下,5000-6000r/min离心10-15min,取上清液至离心管中待用,于上清液中加入0.4-0.6倍体积50%(g/g)聚乙二醇溶液,在4℃环境下放置过夜;所述聚乙二醇的相对分子质量为4000-6000;

C、室温条件下,6000-7000r/min、3-5℃离心25-35min,弃上清液,并于沉淀中加入TE溶液500μL,氯仿-异戊醇体积比为24:1的溶液450-550μL,涡旋混匀,11000-12000r/min,3-5℃离心4-6min,取上清液至离心管中;所述TE溶液各组分的浓度为:10mmol/L Tris-HCl,1mmol/L EDTA,pH=7.5-8.5,溶剂为无菌蒸馏水,优选为灭菌双蒸水;

D、于步骤C所得上清液中加入0.8-1.5倍体积的3mol/LNaAc溶液及0.5-0.6倍体积的异丙醇溶液,沉淀至少2-2.5h,11000-12000r/min,3-5℃离心4-6min,弃掉上清液;

E、于步骤D所得沉淀中加入预冷的70%(v/v)乙醇500-600μL洗涤沉淀,11000-12000r/min,3-5℃离心4-6min,弃掉上清液;

F、沉淀低温真空干燥,即得真菌菌丝体DNA。

10.根据权利要求9所述的真菌菌丝总DNA的提取方法,其特征在于:步骤(5)去酶及纯化DNA包括如下步骤:

A、加入20%(g/g)十二烷基硫酸钠溶液200μL,涡旋混匀后水浴,水浴条件:60℃、1.5h,期间每30min振荡1次;

B、室温条件下,5000r/min离心10min,取上清液至离心管中待用,于上清液中加入0.5倍体积50%(g/g)聚乙二醇溶液,在4℃环境下放置过夜;

C、室温条件下,6000r/min、4℃离心30min,弃上清液,并于沉淀中加入TE溶液500μL,氯仿-异戊醇体积比为24:1的溶液500μL,涡旋混匀,12000r/min、4℃离心5min,取上清液至离心管中;所述TE溶液各组分的浓度为:10mmol/L Tris-HCl,1mmol/L EDTA,pH=8.0,溶剂为无菌蒸馏水;优选为灭菌双蒸水;

D、于步骤C所得上清液中加入0.1倍体积的3mol/LNaAc溶液及0.6倍体积的异丙醇溶液,沉淀至少2h,12000r/min、4℃离心5min,弃掉上清液;

E、于步骤D所得沉淀中加入预冷的70%乙醇500μL洗涤沉淀,12000r/min、4℃离心5min,弃掉上清液;

F、沉淀低温真空干燥,即得真菌菌丝体DNA。

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