[发明专利]一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法有效
申请号: | 201410117235.9 | 申请日: | 2014-03-27 |
公开(公告)号: | CN103898216A | 公开(公告)日: | 2014-07-02 |
发明(设计)人: | 陈仁芳;陈祥平;范小敏;柯皓天;冯永德 | 申请(专利权)人: | 西南大学;四川省丝绸科学研究院;四川省丝绸工程技术研究中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 成都君合集专利代理事务所(普通合伙) 51228 | 代理人: | 廖曾 |
地址: | 404100 *** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 桑树 品种 亲缘 关系 dna 分子 评鉴 方法 | ||
1.一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)桑树品种的系统发育分析:
1)取材;
2)筛选对比序列;
3)桑树基因组DNA提取及浓度、纯度检测;
4)PCR扩增;
5)PCR检测;
6)PCR测序;
7)序列拼接、对比,鉴定进化关系;
(2)桑树品种的亲缘关系分析:
采用DNA分子标记方法对步骤7)获得的进化关系进行亲缘关系分析,获得分析结果。
2.根据权利要求1所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤2)中对比序列为核rDNA内转录间隔区ITS,5SrRNA基因间隔区NTS,26S-18SrRNA基因间隔区IGS序列。
3.根据权利要求1所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤3)中取步骤1)中经硅胶干燥处理后的桑树品种样本0.10—0.20g,通过2—4倍CTAB提取液提取获得桑树基因组DNA并进行浓度、纯度检测及复核。
4.根据权利要求3所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤3)中桑树品种样品通过4倍CTAB提取液提取获得基因组DNA.。
5.根据权利要求3或4所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤3)中干燥桑树品种样本的称取量为0.15g。
6.根据权利要求1所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤4)PCR扩增反应引物为核rDNA内转录间隔区ITS。
7.根据权利要求6所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤4)PCR扩增反应程序为94℃预变性4min,94℃变性1min、55℃退火1min、72℃延伸1min、每个循环94℃变性1min、55℃退火1min、72℃延伸1min共33个循环,72℃延伸7min,反应结束控制在12℃。
8.根据权利要求1所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤2)中所用对比序列为转录组测序。
9.根据权利要求1所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤2)中所用对比序列为全基因组测序。
10.根据权利要求1所述的一种桑树品种亲缘关系DNA分子评鉴方法,其特征在于:所述步骤(2)DNA分子标记方法为ISSR方法或SSR方法。
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