[发明专利]一种检测多种蚊媒病原体的试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201410131703.8 | 申请日: | 2014-04-03 |
公开(公告)号: | CN103911463A | 公开(公告)日: | 2014-07-09 |
发明(设计)人: | 史玲莉;闫冀焕;李云;滑娜;沈军;吴志茹;兰景;李薇;付晓昀 | 申请(专利权)人: | 河北国际旅行卫生保健中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 石家庄众志华清知识产权事务所(特殊普通合伙) 13123 | 代理人: | 墨伟 |
地址: | 050000 河北*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 多种 病原体 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测多种蚊媒病原体的试剂盒,其特征在于该试剂盒包括用于检测下列病原体的探针:黄热病毒的探针YFV-PF、基孔肯雅病毒的探针CHIKV-PF、西尼罗病毒WNV-PF、乙型脑炎病毒的探针JEV-PF、登革I型病毒的探针DV1-PF、登革Ⅱ型病毒的探针DV2-PF、登革Ⅲ型病毒的探针DV3-PF、登革Ⅳ型病毒的探针DV4-PF、间日疟原虫的探针PV-PF、三日疟原虫的探针PM-PF、卵形疟原虫的探针PO-PF和恶性疟原虫的探针PF-PF,上述探针的核苷酸序列分别依次如SEQ ID NO:1-12所示。
2.根据权利要求1所述的检测多种蚊媒病原体的试剂盒,其特征在于所述试剂盒还包括用于扩增下列病原体目的片段的PCR引物对:
黄热病毒的引物对YFV-F和YFV-R,其序列参见SEQ ID NO:13-14;
基孔肯雅病毒的引物对CHIKV-F和CHIKV-R,其序列参见SEQ ID NO:15-16;
西尼罗病毒的引物对WNV-F和WNV-R,其序列参见SEQ ID NO:17-18;
乙型脑炎病毒的引物对JEV-F和JEV-R,其序列参见SEQ ID NO:19-20;
登革I型病毒的引物对DV1-F和DV1-R,其序列参见SEQ ID NO:21-22;
登革Ⅱ型病毒的引物对DV2-F 和DV2-R,其序列参见SEQ ID NO:23-24;
登革Ⅲ型病毒的引物对DV3-F和DV3-R,其序列参见SEQ ID NO:25-26;
登革Ⅳ型病毒的引物对DV4- F和DV4-R,其序列参见SEQ ID NO:27-28;
疟原虫的通用引物对PU-F2和PU-R2,其序列参见SEQ ID NO:29-30。
3.根据权利要求2所述的检测多种蚊媒病原体的试剂盒,其特征在于每对引物对中有一个5’端修饰有生物素标记,每个探针5’端均带有胺基化修饰且连有C12邻接臂序列、并分别与相应荧光标记的微球偶联。
4.根据权利要求2或3所述的检测多种蚊媒病原体的试剂盒,其特征在于所述试剂盒还包括反转录引物混合液,其反转录引物序列参见SEQ ID NO:31-38。
5.一种多种蚊媒病原体的检测方法,基于微球的液相芯片技术,其特征在于具体包括以下步骤:
①合成权利要求2所述的引物对和探针,将每对引物中的下游引物5’端进行生物素标记;将每个探针5’端进行胺基化修饰且连有C12邻接臂序列;
②将所述探针分别与相应荧光编码的微球偶联、然后等数目混合,制得偶联有特异性核酸探针的微球组;
③抽提待测样本的DNA和RNA,并采用多重反转录反应的方法将RNA的特定基因序列反转录成cDNA;
④以cDNA/DNA为模板、采用步骤①中的引物对进行PCR扩增,制得PCR扩增产物;
⑤将PCR扩增产物与微球组温育杂交,然后加入链霉亲和素-藻红蛋白与微球上捕获的PCR扩增产物上的生物素结合,形成微球-探针-PCR产物-生物素-SA-PE的复合物,利用液相芯片系统对待测样品进行定性和定量分析。
6.根据权利要求5所述的多种蚊媒病原体的检测方法,其特征在于步骤③中所述反转录采用权利要求3中的反转录引物混合液。
7.根据权利要求5所述的多种蚊媒病原体的检测方法,其特征在于步骤④中的PCR扩增采用不对称扩增,每对引物对中下游引物的浓度是上游引物浓度的3~8倍。
8.根据权利要求5所述的多种蚊媒病原体的检测方法,其特征在于步骤④中所述PCR扩增采用三个PCR反应体系,分别为PCR反应体系I、PCR反应体系Ⅱ和PCR反应体系Ⅲ;其中PCR反应体系I含有西尼罗病毒引物对WNV-F和WNV-R,PCR反应体系Ⅱ含有黄热病毒的引物对YFV-F和YFV-R、登革I型病毒的引物对DV1-F和DV1-R、以及登革Ⅳ型病毒的引物对DV4- F和DV4-R;PCR反应体系Ⅲ包括CHIKV-F和CHIKV-R、JEV-F和JEV-R、DV2-F和DV2-R、DV3-F和DV3-R、PU-F和PU-R;
步骤⑤中,首先将PCR反应体系I、PCR反应体系Ⅱ和PCR反应体系Ⅲ中取等体积的扩增产物加入至同一试管内,然后再与微球组温育杂交。
9.根据权利要求5所述的多种蚊媒病原体的检测方法,其特征在于步骤⑤中温育杂交的条件为:96℃变性5分钟,55℃杂交30分钟。
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