[发明专利]核酸探针及其制备方法和用途有效
申请号: | 201410140110.8 | 申请日: | 2014-04-09 |
公开(公告)号: | CN104099410A | 公开(公告)日: | 2014-10-15 |
发明(设计)人: | 蒋宇扬 | 申请(专利权)人: | 清华大学深圳研究生院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 518057 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核酸 探针 及其 制备 方法 用途 | ||
1.一种核酸探针,其特征在于,包括:
第一核酸分子,所述第一核酸分子能够与靶标特异性相互作用,并且所述第一核酸分子在与靶标特异性相互作用后展现出催化活性;以及
底物分子,所述底物分子与所述第一核酸分子相连,并且所述底物分子仅在所述第一核酸分子的催化活性作用下,能够产生可检测信号,
任选地,所述第一核酸分子包括:
识别序列,所述识别序列能够识别靶标;
第二核酸分子和第三核酸分子,所述第二核酸分子和第三核酸分子分别与所述识别序列的5’末端和3’末端相连,
任选地,所述识别序列的长度为10-100nt,优选为20-80nt,进一步优选为25-65nt,进一步优选为30-50nt,最优选为35-45nt,
任选地,所述识别序列为选自下列的至少之一:
(a)SEQ ID NO:1~38的至少之一所示的核酸序列;
(b)SEQ ID NO:1~38的至少之一所示的核酸序列的一部分;
(c)与(a)或(b)中所示核酸序列具有至少80%,优选至少90%,更优选至少95%,进一步优选至少99%序列同一性的核酸序列,
任选地,所述识别序列包含TTAGCG的核酸单元,
优选地,所述识别序列为SEQ ID NO:9所示的核酸序列,
任选地,所述第二核酸分子具有SEQ ID NO:39所示的核酸序列,第三核酸分子具有SEQ ID NO:40所示的核酸序列。
2.根据权利要求1所述的核酸探针,其特征在于,所述底物分子包括:
第四核酸分子,所述第四核酸分子可在所述第一核酸分子的催化活性作用下被切割;
第五核酸分子,所述第五核酸分子与所述第四核酸分子的5’端相连;以及
第六核酸分子,所述第六核酸分子与所述第四核酸分子的3’端相连,
其中,
所述第五核酸分子和第六核酸分子之一被信号发生分子修饰,并且
所述第五核酸分子和第六核酸分子的另一个被信号调节分子修饰,
任选地,所述信号发生分子与所述信号调节分子之间的间隔为1~10nt,
任选地,所述信号发生分子为荧光素,所述信号调节分子为荧光淬灭分子,所述可检测信号为荧光信号,
任选地,所述催化活性为RNA剪切功能,所述第四核酸分子由至少一个脱氧核糖核苷酸和/或核糖核苷酸构成。
3.一种核酸探针文库,其由多个权利要求1或2所述的核酸探针构成,
任选地,所述核酸探针文库为完全文库。
4.一种筛选核酸探针的方法,所述核酸探针能够识别预定靶标,其特征在于,所述方法包括:
将含有所述预定靶标的第一样品与候选核酸探针接触;以及
筛选产生可检测信号的核酸探针作为能够识别预定靶标的核酸探针,
其中,所述候选核酸探针为权利要求3所述的核酸探针文库的至少一部分,
任选地,进一步包括:
将不含所述预定靶标的第二样品与所述候选核酸探针接触;以及
去除其中产生可检测信号的核酸探针,
任选地,所述方法包括:
(1)重复进行至少一轮下列步骤:
将含有所述预定靶标的第一样品与候选核酸探针接触;以及
筛选产生可检测信号的核酸探针;
(2)将步骤(1)中所得到的核酸探针,重复进行至少一轮下列步骤:
将不含所述预定靶标的第二样品与步骤(1)中所得到的核酸探针接触;以及
去除其中产生可检测信号的核酸探针;
(3)将步骤(2)中所得到的核酸探针,重复进行至少一轮下列步骤:
将含有所述预定靶标的第三样品与步骤(2)中所得到的核酸探针接触;以及
筛选产生可检测信号的核酸探针,以便获得能够识别预定靶标的核酸探针。
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