[发明专利]核酸探针及其制备方法和用途有效

专利信息
申请号: 201410140110.8 申请日: 2014-04-09
公开(公告)号: CN104099410A 公开(公告)日: 2014-10-15
发明(设计)人: 蒋宇扬 申请(专利权)人: 清华大学深圳研究生院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 李志东
地址: 518057 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 核酸 探针 及其 制备 方法 用途
【权利要求书】:

1.一种核酸探针,其特征在于,包括:

第一核酸分子,所述第一核酸分子能够与靶标特异性相互作用,并且所述第一核酸分子在与靶标特异性相互作用后展现出催化活性;以及

底物分子,所述底物分子与所述第一核酸分子相连,并且所述底物分子仅在所述第一核酸分子的催化活性作用下,能够产生可检测信号,

任选地,所述第一核酸分子包括:

识别序列,所述识别序列能够识别靶标;

第二核酸分子和第三核酸分子,所述第二核酸分子和第三核酸分子分别与所述识别序列的5’末端和3’末端相连,

任选地,所述识别序列的长度为10-100nt,优选为20-80nt,进一步优选为25-65nt,进一步优选为30-50nt,最优选为35-45nt,

任选地,所述识别序列为选自下列的至少之一:

(a)SEQ ID NO:1~38的至少之一所示的核酸序列;

(b)SEQ ID NO:1~38的至少之一所示的核酸序列的一部分;

(c)与(a)或(b)中所示核酸序列具有至少80%,优选至少90%,更优选至少95%,进一步优选至少99%序列同一性的核酸序列,

任选地,所述识别序列包含TTAGCG的核酸单元,

优选地,所述识别序列为SEQ ID NO:9所示的核酸序列,

任选地,所述第二核酸分子具有SEQ ID NO:39所示的核酸序列,第三核酸分子具有SEQ ID NO:40所示的核酸序列。

2.根据权利要求1所述的核酸探针,其特征在于,所述底物分子包括:

第四核酸分子,所述第四核酸分子可在所述第一核酸分子的催化活性作用下被切割;

第五核酸分子,所述第五核酸分子与所述第四核酸分子的5’端相连;以及

第六核酸分子,所述第六核酸分子与所述第四核酸分子的3’端相连,

其中,

所述第五核酸分子和第六核酸分子之一被信号发生分子修饰,并且

所述第五核酸分子和第六核酸分子的另一个被信号调节分子修饰,

任选地,所述信号发生分子与所述信号调节分子之间的间隔为1~10nt,

任选地,所述信号发生分子为荧光素,所述信号调节分子为荧光淬灭分子,所述可检测信号为荧光信号,

任选地,所述催化活性为RNA剪切功能,所述第四核酸分子由至少一个脱氧核糖核苷酸和/或核糖核苷酸构成。

3.一种核酸探针文库,其由多个权利要求1或2所述的核酸探针构成,

任选地,所述核酸探针文库为完全文库。

4.一种筛选核酸探针的方法,所述核酸探针能够识别预定靶标,其特征在于,所述方法包括:

将含有所述预定靶标的第一样品与候选核酸探针接触;以及

筛选产生可检测信号的核酸探针作为能够识别预定靶标的核酸探针,

其中,所述候选核酸探针为权利要求3所述的核酸探针文库的至少一部分,

任选地,进一步包括:

将不含所述预定靶标的第二样品与所述候选核酸探针接触;以及

去除其中产生可检测信号的核酸探针,

任选地,所述方法包括:

(1)重复进行至少一轮下列步骤:

将含有所述预定靶标的第一样品与候选核酸探针接触;以及

筛选产生可检测信号的核酸探针;

(2)将步骤(1)中所得到的核酸探针,重复进行至少一轮下列步骤:

将不含所述预定靶标的第二样品与步骤(1)中所得到的核酸探针接触;以及

去除其中产生可检测信号的核酸探针;

(3)将步骤(2)中所得到的核酸探针,重复进行至少一轮下列步骤:

将含有所述预定靶标的第三样品与步骤(2)中所得到的核酸探针接触;以及

筛选产生可检测信号的核酸探针,以便获得能够识别预定靶标的核酸探针。

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