[发明专利]一种检测柑橘衰退病毒T3基因型的实时荧光定量RT-PCR方法无效
申请号: | 201410142402.5 | 申请日: | 2014-04-11 |
公开(公告)号: | CN103937909A | 公开(公告)日: | 2014-07-23 |
发明(设计)人: | 陶珍珍;周常勇;周彦;宋震;李中安 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院柑桔研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94 |
代理公司: | 重庆市前沿专利事务所(普通合伙) 50211 | 代理人: | 郭云 |
地址: | 400712 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 柑橘 衰退 病毒 t3 基因型 实时 荧光 定量 rt pcr 方法 | ||
1.一种检测柑橘衰退病毒T3基因型的实时荧光定量RT-PCR方法,包括以下步骤:
1)提取待测样品总RNA作为反应模板;
2)以步骤1所提取的RNA为模板,利用T3基因型的特异性引物T3-4R进行反转录反应,得到反转录产物cDNA;
3)利用特异性引物T3-4F和T3-4R,以及步骤2得到的反转录产物cDNA为模板进行实时荧光定量RT-PCR检测;
所述的特异性引物T3-4F和T3-4R序列如下:
T3-4F:TCTAAATTCTACCCGAGGCAT
T3-4R:TTTTCCGCTTGTGTATAAACGA。
2.根据权利要求1所述的一种检测柑橘衰退病毒T3基因型的实时荧光定量RT-PCR方法,其特征在于:
所述步骤2的反转录反应,反应体系为:总反应体系10μL,其中RNA反应模板4μL,5×RT-buffer 2μL,浓度为10mM/L的dNTPs 0.5μL,浓度为10μmol/L的引物T3-4R 0.5μL,浓度为30U/L的RNA酶抑制剂RNasin 0.5μL,浓度为100U/μL的反转录酶RTase 0.5μL,无RNase超纯水2μL;反应程序为:42℃反转录30分钟,94℃加热1分钟。
3.根据权利要求1所述的一种检测柑橘衰退病毒T3基因型的实时荧光定量RT-PCR方法,其特征在于:
所述步骤3的实时荧光定量PCR反应,反应体系为:总反应体系20μL,其 中2×SYBR Green Supermix10μL,浓度为10μmol/L的引物T3-4F和T3-4R各0.2μL,无RNase超纯水8.6μL,步骤2得到的反转录产物cDNA模板1μL;PCR扩增程序为:95℃预变性30秒,95℃变性5秒,63℃退火15秒,72℃延伸20秒,40个循环。
4.根据权利要求1所述的一种检测柑橘衰退病毒T3基因型的实时荧光定量RT-PCR方法,其特征在于:
所述步骤3的实时荧光定量PCR反应检测,以柑橘Fbox基因为内参照基因,采用2-ΔΔCt方法对CTV T3基因进行相对定量分析。
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