[发明专利]一种水蛭的DNA条形码分子鉴定方法有效
申请号: | 201410162545.2 | 申请日: | 2014-04-21 |
公开(公告)号: | CN103898235B | 公开(公告)日: | 2017-03-15 |
发明(设计)人: | 李振国;陈艳明;务勇圣 | 申请(专利权)人: | 牡丹江友搏药业有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 157013 黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 水蛭 dna 条形码 分子 鉴定 方法 | ||
技术领域
本发明涉及物种鉴定领域,具体涉及一种宽体金线蛭DNA条形码分子鉴定方法。
背景技术
宽体金线蛭(学名:Whitmania pigra)是传统的名贵中药材,是2010版《中国药典》收录的药材水蛭主要基原动物之一,具有破瘀通经,消积散结等功效,也是疏血通等众多治疗心脏血管疾病中药的主要原料。因此,对宽体金线蛭的鉴定是入药的基础。在我国的药材市场,大部分动物药都是贵重、紧缺药材,通常以粉末等形式入药,市场较为混乱,鉴别十分困难。至于水蛭,在药材市场上,来源相对清晰,但是仍有部分伪品在市场内流通。目前,传统的性状鉴别缺乏准确的内部解剖特征或者是在贮藏、加工炮制过程中形态被严重破坏,基于形态结构细微差别的归类描述稳定性差,可信度低,导致水蛭的鉴定存在很大困难,因此,亟需寻求一种新的方法,以弥补传统分类方法的缺陷。
DNA条形码技术(DNA Barcoding)是通过对一个标准目的基因的DNA序列进行分析,从而快速、准确地进行物种鉴定的技术。目前在动物中最常用的DNA barcode是细胞色素C氧化酶1号基因(COI)的部分序列。近几年来,DNA条形码技术已被证明是一个行之有效的生物鉴定手段,不仅可对传统鉴定方法作强有力的补充,而且因为其更客观、准确,突破以往对经验的过度依赖,能帮助鉴定物种、发现新种和隐种、重建物种和高级阶元的演化关系等。运用DNA条形码技术,可以很好的对水蛭的品种进行快速、有效的鉴定。
本发明提供一种关于宽体金线蛭DNA条形码分子鉴定的方法,有利于实现宽体金线蛭的快速准确鉴定,缩短鉴定时间。
发明内容
本发明克服目前以形态学鉴定水蛭方法存在的缺陷,提高宽体金线蛭鉴定结果的准确度,是一种易于操作、灵敏度高的鉴定方法。本发明的技术方案如下:
首先从采集的各种水蛭提取总DNA,利用一对引物进行PCR扩增一段COI基因片段,将扩增产物测序,然后进行序列分析比对,建立各种水蛭的序列标准数据库,在比较数据库DNA的基础上,通过分析在特定条件下的聚合酶链式反应的产物结果,从而达到快速,准确鉴定宽体金线蛭的目的。对需要鉴定的水蛭样品,提取其总DNA,在给定的条件下,用设计的特异引物进行PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳确定PCR扩增产物结果,然后测序,根据 序列比对可以鉴定出宽体金线蛭。本发明设计的用于鉴别宽体金线蛭的分子鉴定方法,采用如下步骤:
1、提取水蛭总DNA按常规动物DNA提取方法或者血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取,并用灭菌的去离子水将样品的DNA浓度稀释到0.1μg/μl-2μg/μl。
2、扩增DNA片段,进行聚合酶链式反应,即用特异的引物进行扩增,引物对序列为
LCO1490:5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′;
HCO2198:5′-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′;
扩增程序为94℃预变性1分钟,45℃退火1.5分钟,72℃延伸1.5分钟,5个循环94℃变性1分钟,50℃退火1.5分钟,72℃延伸1分钟,35个循环72℃延伸5分钟。
3、将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,使用DNA marker检测PCR片段大小。
4、鉴定结果的判断:若出现明显清晰的709bp大小的条带,且无杂带,则可送生物公司测序。
5、将测序结果进行手工校对、序列拼接,如果与所述基因序列SEQ ID NO.1同源性在99%以上,即可判断所述的待测组织即为宽体金线蛭。
其中,所述的水蛭DNA条形码分子鉴定方法采用的是血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒。
所述引物,正向引物为5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′反向引物为5′-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′。
所使用的DNA聚合酶为pfu高保真酶。
所述的电泳为1%-2%的琼脂糖凝胶电泳。
所述的条带大小需要用DNA maker检测。
所述的DNA序列拼接软件包括CodonCode Aligner、Sequencher、Genious、DNA star等软件。
与传统的形态学鉴定方法相比,本发明获得的基因序列有利于实现宽体金线蛭的分子鉴定。
附图说明
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于牡丹江友搏药业有限责任公司,未经牡丹江友搏药业有限责任公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201410162545.2/2.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:一种水槽出水管防堵机构
- 下一篇:用于癌症治疗的预测物