[发明专利]一种水蛭的DNA条形码分子鉴定方法有效

专利信息
申请号: 201410162545.2 申请日: 2014-04-21
公开(公告)号: CN103898235B 公开(公告)日: 2017-03-15
发明(设计)人: 李振国;陈艳明;务勇圣 申请(专利权)人: 牡丹江友搏药业有限责任公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 157013 黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 一种 水蛭 dna 条形码 分子 鉴定 方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及物种鉴定领域,具体涉及一种宽体金线蛭DNA条形码分子鉴定方法。 

背景技术

宽体金线蛭(学名:Whitmania pigra)是传统的名贵中药材,是2010版《中国药典》收录的药材水蛭主要基原动物之一,具有破瘀通经,消积散结等功效,也是疏血通等众多治疗心脏血管疾病中药的主要原料。因此,对宽体金线蛭的鉴定是入药的基础。在我国的药材市场,大部分动物药都是贵重、紧缺药材,通常以粉末等形式入药,市场较为混乱,鉴别十分困难。至于水蛭,在药材市场上,来源相对清晰,但是仍有部分伪品在市场内流通。目前,传统的性状鉴别缺乏准确的内部解剖特征或者是在贮藏、加工炮制过程中形态被严重破坏,基于形态结构细微差别的归类描述稳定性差,可信度低,导致水蛭的鉴定存在很大困难,因此,亟需寻求一种新的方法,以弥补传统分类方法的缺陷。 

DNA条形码技术(DNA Barcoding)是通过对一个标准目的基因的DNA序列进行分析,从而快速、准确地进行物种鉴定的技术。目前在动物中最常用的DNA barcode是细胞色素C氧化酶1号基因(COI)的部分序列。近几年来,DNA条形码技术已被证明是一个行之有效的生物鉴定手段,不仅可对传统鉴定方法作强有力的补充,而且因为其更客观、准确,突破以往对经验的过度依赖,能帮助鉴定物种、发现新种和隐种、重建物种和高级阶元的演化关系等。运用DNA条形码技术,可以很好的对水蛭的品种进行快速、有效的鉴定。 

本发明提供一种关于宽体金线蛭DNA条形码分子鉴定的方法,有利于实现宽体金线蛭的快速准确鉴定,缩短鉴定时间。 

发明内容

本发明克服目前以形态学鉴定水蛭方法存在的缺陷,提高宽体金线蛭鉴定结果的准确度,是一种易于操作、灵敏度高的鉴定方法。本发明的技术方案如下: 

首先从采集的各种水蛭提取总DNA,利用一对引物进行PCR扩增一段COI基因片段,将扩增产物测序,然后进行序列分析比对,建立各种水蛭的序列标准数据库,在比较数据库DNA的基础上,通过分析在特定条件下的聚合酶链式反应的产物结果,从而达到快速,准确鉴定宽体金线蛭的目的。对需要鉴定的水蛭样品,提取其总DNA,在给定的条件下,用设计的特异引物进行PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳确定PCR扩增产物结果,然后测序,根据 序列比对可以鉴定出宽体金线蛭。本发明设计的用于鉴别宽体金线蛭的分子鉴定方法,采用如下步骤: 

1、提取水蛭总DNA按常规动物DNA提取方法或者血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取,并用灭菌的去离子水将样品的DNA浓度稀释到0.1μg/μl-2μg/μl。 

2、扩增DNA片段,进行聚合酶链式反应,即用特异的引物进行扩增,引物对序列为 

LCO1490:5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′; 

HCO2198:5′-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′; 

扩增程序为94℃预变性1分钟,45℃退火1.5分钟,72℃延伸1.5分钟,5个循环94℃变性1分钟,50℃退火1.5分钟,72℃延伸1分钟,35个循环72℃延伸5分钟。 

3、将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,使用DNA marker检测PCR片段大小。 

4、鉴定结果的判断:若出现明显清晰的709bp大小的条带,且无杂带,则可送生物公司测序。 

5、将测序结果进行手工校对、序列拼接,如果与所述基因序列SEQ ID NO.1同源性在99%以上,即可判断所述的待测组织即为宽体金线蛭。 

其中,所述的水蛭DNA条形码分子鉴定方法采用的是血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒。 

所述引物,正向引物为5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′反向引物为5′-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′。 

所使用的DNA聚合酶为pfu高保真酶。 

所述的电泳为1%-2%的琼脂糖凝胶电泳。 

所述的条带大小需要用DNA maker检测。 

所述的DNA序列拼接软件包括CodonCode Aligner、Sequencher、Genious、DNA star等软件。 

与传统的形态学鉴定方法相比,本发明获得的基因序列有利于实现宽体金线蛭的分子鉴定。 

附图说明

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