[发明专利]一种基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法在审
申请号: | 201410178020.8 | 申请日: | 2014-04-29 |
公开(公告)号: | CN105018582A | 公开(公告)日: | 2015-11-04 |
发明(设计)人: | 孙子奎;高文学;丁方美;王锋;方钰 | 申请(专利权)人: | 上海桑尼生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/44 |
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地址: | 201401 上海市嘉*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 酶切法 检测 蛋白 基因型 方法 | ||
1.一种基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
根据β-酪蛋白的碱基序列,设计出含有Dde I酶切位点的引物,所述引物的序列为:
上游引物:5’ACC CCA ATT TCT TAA CCA AAC C3’
下游引物:5’GAG TAA GAG GAG GGA TGT TTT GTG GGA GGC TCT3’;
利用引物扩增出片段,所述片段可使A2β-酪蛋白中产生一个Dde I酶切位点;
用引物对待检测的奶牛基因组DNA进行PCR扩增;
利用限制性内切酶Dde I进行酶切,根据琼脂糖凝胶电泳的结果进行判断。
2.根据权利要求1所述基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,根据琼脂糖凝胶电泳的结果进行判断,具体为:
如果PCR扩增后的产物无法被Dde I切开或存在一个253bp的条带,则β-酪蛋白为A1β-酪蛋白;
如果PCR扩增后的产物进行酶切后同时存在一个218bp的条带和一个35bp的条带,则β-酪蛋白为A2β-酪蛋白;
如果PCR扩增后的产物进行酶切后同时存在一个218bp的条带和一个253bp的条带,则β-酪蛋白为A1A2β-酪蛋白。
3.根据权利要求1所述基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,所述酶切的体系包括PCR产物9ul、限制性内切酶0.2ul和缓冲液1ul;所述酶切的条件为37℃孵育1-8h,65℃热失活20min。
4.根据权利要求3所述基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,在β-酪蛋白的67位氨基酸附近设计出含有Dde I酶切位点的引物,所述酶切的条件为37℃孵育2h,65℃热失活20min。
5.根据权利要求1至4任一所述基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,所述PCR扩增的体系为DNA模板50ng、热启动Taq DNA聚合酶0.1U/ul、2.5uM dNTP1ul、10uM上下游引物各1ul、2×Lengend PCR Buffer10ul、加ddH2O至20ul。
6.根据权利要求5所述基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,所述PCR扩增的条件:在温度为92-95℃时预变性5min,然后在温度为92-95℃时变性15s、在温度为52-65℃时退火30s、在温度为68-72℃时延伸30s,进行多个循环,最后在温度为68-72℃时延伸7min。
7.根据权利要求6所述基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,所述PCR扩增进行35个循环。
8.根据权利要求7所述基于酶切法检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,所述PCR扩增的条件:在温度为95℃时预变性5min,然后在温度为95℃时变性15s、在温度为61℃时退火30s、在温度为72℃时延伸30s,进行35个循环,最后在温度为72℃时延伸7min。
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