[发明专利]用于刺参腐皮综合症早期诊断的分子标记物及其扩增引物和应用有效
申请号: | 201410209458.8 | 申请日: | 2014-05-16 |
公开(公告)号: | CN104017864A | 公开(公告)日: | 2014-09-03 |
发明(设计)人: | 李成华;张鹏娟;金春华;李太武;李晔;欧昌荣;张卫卫 | 申请(专利权)人: | 宁波大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 宁波奥圣专利代理事务所(普通合伙) 33226 | 代理人: | 何仲 |
地址: | 315211 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 刺参 综合症 早期 诊断 分子 标记 及其 扩增 引物 应用 | ||
1.一种用于刺参腐皮综合症早期诊断的分子标记物,其特征在于所述的分子标记物的基因片段如下:分子标记物miR-137基因片段的核苷酸序列为5’-UAUUGCUUGAGAAUACACGUAG-3’,分子标记物miR-2008基因片段的核苷酸序列为5’-AUCAGCCUCGCUGUCAAUACG-3’。
2.一种用于刺参腐皮综合症早期诊断的分子标记物扩增引物,其特征在于:扩增权利要求1所述的miR-137基因片段的正向引物的核苷酸序列为:5’-TATTGCTTGAGAATACACGTAG-3’, 扩增权利要求1所述的miR-2008基因片段的正向引物的核苷酸序列为:5’-ATCAGCCTCGCTGTCAATACG-3,扩增RNU6B内参基因的正向引物的核苷酸序列为:5’-CGTGAAGCGTTCCATATTTTAA-3’。
3.一种用于刺参腐皮综合症早期诊断的试剂盒,其特征在于包括权利要求2所述的扩增miR-137基因片段的正向引物:5’-TATTGCTTGAGAATACACGTAG-3’、扩增miR-2008基因片段的正向引物:5’-ATCAGCCTCGCTGTCAATACG-3以及扩增RNU6B内参基因的正向引物:5’-CGTGAAGCGTTCCATATTTTAA-3’。
4.一种利用权利要求1所述的刺参腐皮综合症早期诊断的分子标记物的检测方法,其特征在于步骤如下:
a、总RNA的提取:取刺参体腔液1.0mL,800g离心5min,收集血细胞,加入RNAiso-plus试剂(购于Takara公司)1.0mL,震荡混匀,室温放置5min,再加入0.2mL氯仿,震荡混匀,室温静置10min,4℃,12000rpm, 离心15min,吸取上清至PE管中,加入该上清等体积的异丙醇,混匀,室温静置5min,4℃,12000rpm, 离心10min,去上清,在沉淀中加入质量百分浓度为75%的乙醇1mL, 4℃,12000rpm, 离心5min,去上清,沉淀静置5-10min,加20μL无RNA酶水,得到RNA提取液;
b、cDNA合成:取500ng上述RNA提取液用miScript 反转录试剂盒(Qiagen, Germany)合成,得到cDNA,具体合成方法依cDNA合成试剂盒说明书进行;
c、PCR扩增:利用miScript SYBR Green PCR试剂盒进行(Qiagen, Germany),20ul扩增体系:SYBR Green混合液10.0ul,引物溶液1ul,cDNA溶液1ul,ddH2O 补充至20ul ;扩增反应条件:95℃ 15 min,94℃ 15s,60℃ 30s,70℃ 30s,共40个循环,反应完成后进行熔解曲线分析;其中引物溶液包括扩增miR-137基因片段的正向引物:5’-TATTGCTTGAGAATACACGTAG-3’, 扩增miR-2008基因片段的正向引物:5’-ATCAGCCTCGCTGTCAATACG-3’、 扩增miR-137基因片段和miR-2008基因片段的反向引物为通用引物,各引物浓度均为10uM,内参基因为RNU6B,扩增RNU6B内参基因用正向引物为5’-CGTGAAGCGTTCCATATTTTAA-3’,反向引物为通用引物;
d、鉴定:扩增完成后,利用2-△△CT方法分析基因表达量,若miR-137基因片段和miR-2008基因片段同时高水平表达,且表达倍数高于2.3则认为刺参处于腐皮综合症发病早期。
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