[发明专利]限制性内切酶和核酸外切酶Ⅲ的无标记荧光检测DNA甲基化和甲基转移酶活性的检测方法有效

专利信息
申请号: 201410220070.8 申请日: 2014-05-22
公开(公告)号: CN103993083A 公开(公告)日: 2014-08-20
发明(设计)人: 卫伟;高春燕;刘松琴 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/48;C12Q1/34
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 沈振涛
地址: 211189 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 限制性 内切酶 核酸外切酶 标记 荧光 检测 dna 甲基化 甲基转移酶 活性 方法
【权利要求书】:

1.一种基于限制性内切酶和核酸外切酶Ⅲ无标记荧光检测DNA甲基化和甲基转移酶活性的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)无标记的探针DNA和目标DNA的选取:所述无标记的探针DNA和目标DNA部分互补,并且都包含一段能被限制性内切酶识别并切割的5'-CCGG-3'特定序列,并且3'尾部分别都多出6个碱基序列;

(2)无标记的探针DNA与目标DNA的杂交;

(3)甲基化转移酶对双链DNA上CpG位点进行甲基化;

(4)对甲基化敏感的限制性内切酶HpaⅡ和核酸外切酶ⅢExoⅢ同时作用DNA;

(5)加入荧光信号分子;

(6)利用荧光分光度计对产物溶液进行检测。

2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述荧光信号分子为噻唑橙。

3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述检测方法的具体步骤如下:取无标记的探针DNA和目标DNA以及缓冲溶液于离心管中杂交,然后加入甲基转移酶使其CpG位点上的胞嘧啶甲基化,37℃反应1小时后,加入限制性内切酶HpaⅡ和核酸外切酶ⅢExoⅢ,37℃反应2.5小时,最后加入噻唑橙,室温条件反应1小时后,对其溶液进行荧光检测。

4.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于,所述无标记的探针DNA和目标DNA浓度在缓冲液中的终浓度分别为10~100nM。

5.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于,所述缓冲溶液为含有NaCl、MgCl2、BSA和DTT的pH7~8的10~80mM的Tris-HCl,所述NaCl初始浓度为100~500mM,MgCl2初始浓度为2~10mM,BSA初始浓度为为0.05~5mg/mL,DTT初始浓度为0.05~10mM。

6.根据权利要求1或3任一项所述的检测方法,其特征在于,所述甲基转移酶在缓冲液中的终浓度为1~16U/mL。

7.根据权利要求1或3任一项所述的检测方法,其特征在于,所述限制性内切酶HpaⅡ在缓冲液中的终浓度为0~60U/mL。

8.根据权利要求1或3任一项所述的检测方法,其特征在于,所述核酸外切酶Ⅲ在缓冲液中的终浓度为0~200U/mL。

9.根据权利要求1或3任一项所述的检测方法,其特征在于,所述噻唑橙在缓冲液中的终浓度为0.7~3.0μM。

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