[发明专利]一种胃癌的唾液蛋白诊断模型及其建立方法无效
申请号: | 201410233882.6 | 申请日: | 2014-05-29 |
公开(公告)号: | CN104007169A | 公开(公告)日: | 2014-08-27 |
发明(设计)人: | 吴正治;孙珂焕;曹美群 | 申请(专利权)人: | 深圳市第二人民医院 |
主分类号: | G01N27/64 | 分类号: | G01N27/64;G01N1/28 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 518020 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 胃癌 唾液 蛋白 诊断 模型 及其 建立 方法 | ||
1.一种胃癌的唾液蛋白诊断模型的建立方法,其特征在于,该胃癌的唾液蛋白诊断模型的建立方法包括以下步骤:
步骤一,唾液标本的收集和处理;
步骤二,采用WCX磁珠处理唾液样品,加入稳定缓冲液的洗脱液可以用来直接质谱分析;
步骤三,点样及质谱分析:将磁珠处理好的多肽样品溶液各取分别点靶,室温下干燥后,再各点基质溶液,然后将制备好的点样板置于MALDI-TOF质谱仪上进行分析;
步骤四,数据统计学分析:用FlexAnalysis3.0软件进行标峰和校正峰,用软件ClinProTools2.1中的统计学检验方法寻找差异蛋白,分析有差异趋势的多肽,并利用软件中的遗传算法结合KNN建立分类预测模型;
建立分类预测模型的方法为:
首先使用遗传算法,设变异率为0.2,交叉率为0.5,初始染色体个数为1000,适应度函数用KNN判定结果的准确率,最终经过10000次进化,遍历k,最终在差异蛋白中,选用了几个蛋白峰,建立模型,计算模型的特异性、敏感性及平均准确率用随机抽样方法,随机选择80%样本建立模型,其余的20%作为验证样本,运行十次,验证模型的有效性,平均特异性、灵敏性及平均正确率。
2.一种胃癌的唾液蛋白诊断模型,其特征在于,该胃癌的唾液蛋白诊断模型由人唾液蛋白中质荷比(m/z)分别为1472.78Da、2936.49Da、6556.81Da和7081.17Da的4个唾液蛋白峰组成。
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