[发明专利]一种用于快速检测甘蔗黑穗病菌的LAMP引物组、试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201410244204.X | 申请日: | 2014-06-04 |
公开(公告)号: | CN104031997A | 公开(公告)日: | 2014-09-10 |
发明(设计)人: | 沈万宽;徐刚红;罗明珠 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 快速 检测 甘蔗 黑穗病 lamp 引物 试剂盒 及其 方法 | ||
1. 一种用于检测甘蔗黑穗病菌的LAMP引物组,其特征在于,所述引物组包含一对外引物对F3/B3和一对内引物对FIP/BIP,引物序列如SEQ ID NO:1~4所示。
2. 一种用于检测甘蔗黑穗病菌的LAMP试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1所述引物组。
3. 根据权利要求2所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还含有基因组DNA提取液、LAMP反应液、阳性对照品、阴性对照品、稳定液和显色液;所述LAMP反应液除含有权利要求1所述引物组还含有Bst DNA聚合酶和检测基础液。
4. 根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述基因组DNA提取液为CTAB提取液。
5. 根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述检测基础液为终浓度为1.3~1.5 mmol/L dNTPs、0.6~0.9 mmol/L甜菜碱和7~9 mmol/L MgSO4。
6. 根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述阳性对照品为甘蔗黑穗病菌基因组DNA;所述阴性对照品为无菌水。
7. 根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述稳定液为石蜡油;所述显色液为SYBR Green I。
8. 根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的反应体系为:基因组DNA 2.5μL,8U/μL的Bst DNA聚合酶0.5μL,检测基础液19μL,0.2 μmol/L 的F3/B3引物各0.5μL,1.6 μmol/L的 FIP/BIP引物各1μL;所述检测基础液为终浓度为1.3~1.5 mmol/L dNTPs、0.6~0.9 mmol/L甜菜碱和7~9 mmol/L MgSO4。
9. 根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的反应程序为63~65℃ 1 h,80~82℃ 5 min,4℃保存。
10. 利用权利要求1所述引物组或权利要求2至9任一项所述试剂盒检测甘蔗黑穗病菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1. 基因组DNA提取:处理甘蔗得到甘蔗黑穗病菌基因组总DNA;
S2. 配制反应体系,在反应体系中加入稳定液,在反应管内壁加入显色液;所述稳定液的加入量为45~50 μL,显色液的加入量为1.5~2 μL;
S3. 环介导等温扩增:以基因组总DNA为模板,利用引物组经扩增得到扩增产物;所述引物组包含一对外引物对F3/B3和一对内引物对FIP/BIP,引物序列如SEQ ID NO:1~4所示;所述扩增反应的程序为63~65℃ 1 h,80~82℃ 5 min,4℃保存;
S4. 扩增产物检测:利用显色法对扩增产物进行分析,观察颜色变化,反应产物颜色变为绿色,说明待测样品含有甘蔗黑穗病菌;反应产物变为橙色,则不含有甘蔗黑穗病菌。
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