[发明专利]定点引入不配对区域的高效保真PCR方法有效
申请号: | 201410245609.5 | 申请日: | 2014-06-04 |
公开(公告)号: | CN104031907B | 公开(公告)日: | 2018-09-18 |
发明(设计)人: | 王贝贝 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 张法高;赵杭丽 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 定点 引入 配对 区域 高效 保真 pcr 方法 | ||
1.一种定点引入不配对区域的高效保真PCR方法,通过以下步骤实现:
(1)根据目标基因CDNA序列及所需引入不配对碱基设计引物,其规则为:5’端→3’端:不配对区3’端后有18个碱基及以上的CDNA上游配对区;
(2)取酶用量按理论要求所需最低用量,建立50μ1 PCR体系,按配对碱基数计算PCR退火温度;扩增得到具有与原始模板不配对的区域的第一阶段产物,所述的50μ1 PCR体系为:
cDNA模板: 4.0μl
10×PCR缓冲液: 5.0μl
2.5mM dNTP: 4.0μl
25mM Mg2+ :5.0μl
10pM/10pM上游引物/下游引物:2.0/2.0μl
5U/μl Tag 酶:0.2μl
双蒸水 补足至50μl;
其特征在于,
(3)取第一步产物为模板,模板的体积小于等于第二步骤反应体系的1/10,建立50μ1PCR体系,并根据配对碱基数的增加可相应提高退火温度,按扩增效率选择循环数,以高保真酶扩增得到第二阶段产物,所述的50μ1 PCR体系为:
第一步PCR产物: 4.0μl
10×PCR缓冲液: 5.0μl
2.5mM dNTP: 4.0μl
25mM Mg2+ :2.5μl
10pM/10pM 上/下游引物:2.0/2.0μl
5U/μl Pfu酶:1.0μl
双蒸水 补足至50μl;
其中步骤(1)所述不配对区为特定位点的定向碱基突变,包括含酶切位点的引物区域或点突变区域;步骤(2)选取Tag 酶,进行3-5个循环扩增;步骤(3)取第一步产物为模板,取高保真PCR聚合酶Pfu酶,建立PCR体系。
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