[发明专利]一种日本囊对虾放流效果的评估方法有效
申请号: | 201410247079.8 | 申请日: | 2014-06-05 |
公开(公告)号: | CN104099412A | 公开(公告)日: | 2014-10-15 |
发明(设计)人: | 蒋科技;胡敬环;张凤英;宋炜;马凌波;程家骅;李圣法;姜亚洲;马春艳;张丹;房娅博;乔振国 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院东海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 200090 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 日本 对虾 效果 评估 方法 | ||
1.一种日本囊对虾放流效果的评估方法,包括:
(1)采集日本囊对虾放流区域的野生群体和准备用于放流的繁育群体,选用线粒体序列中的片段作为研究对象,通过PCR扩增和测序,分析野生群体和繁育群体的序列差异和单倍型分布,统计各单倍型的群体内频率;
(2)筛选出代表日本囊对虾种内差异的单倍型作为分子标记,确定该标记的序列特异性,计算分子标记在野生群体中所占的比例,定期监测比例变动范围;
(3)选定在野生群体中历年所占比例变动小的分子标记,将带有选定的分子标记的母虾用于人工繁育放流用的子一代;
(4)在捕捞期回捕放流区域的个体,检测分子标记,计算带有选定的分子标记的个体在回捕群体中的比例,确定比例变动情况,从而估算放流群体对该区域所有日本囊对虾生态量的贡献值,最终确定该批次的放流效果。
2.根据权利要求1所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:所述步骤(1)中的线粒体序列为细胞色素B基因DNA序列、D-loop区序列或COI序列。
3.根据权利要求2所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:所述细胞色素B基因DNA序列如SEQ ID NO:1所示;对应的PCR扩增引物MJ-CYTB-F、MJ-CYTB-R序列如SEQ ID NO:2和NO:3所示。
4.根据权利要求1所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:所述步骤(1)中的PCR反应体系为:30μL反应体系,其中包括3μL10×PCR缓冲液,引物的浓度均为10μM,上游引物和下游引物分别为0.5μL,1μL2.5mM each dNTP,0.5μL Taq DNA聚合酶,0.5μL DNA模板;补充23.5μL去离子水至30μL。
5.根据权利要求1所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:所述步骤(1)中的PCR反应条件为:94℃预变性5min,94℃变性30s,50℃退火45s,72℃延伸70s,共28个循环,最后72℃延伸7min,10℃保存并结束程序。
6.根据权利要求1所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:所述步骤(2)中的变动范围要求不超过5%。
7.根据权利要求1所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:所述步骤(3)中放流前对增殖群体的母本、子代预先进行检测,以确定选定的分子标记的有效性、可检出性,并确定子一代携带的分子标记与用于繁育的母虾一致。
8.根据权利要求1所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:连续多年对分子标记进行追踪检测,评估该批次放流的长期效果。
9.根据权利要求1所述的一种日本囊对虾放流效果的评估方法,其特征在于:不同批次的放流选用不同的分子标记,以分别评估各个批次的放流效果。
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