[发明专利]植物寄生线虫核糖体ITS区通用扩增引物新组合及其使用方法有效
申请号: | 201410257542.7 | 申请日: | 2014-06-11 |
公开(公告)号: | CN104032002A | 公开(公告)日: | 2014-09-10 |
发明(设计)人: | 王金成;顾建锋;林宇;郭京泽;牛春敬;陈先锋;黄国明 | 申请(专利权)人: | 天津出入境检验检疫局动植物与食品检测中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京亿腾知识产权代理事务所 11309 | 代理人: | 陈惠莲 |
地址: | 300461 天津市滨*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 植物 寄生 线虫 核糖体 its 通用 扩增 引物 组合 及其 使用方法 | ||
1.一种植物寄生线虫核糖体ITS区通用扩增的引物组合,所述引物组合包括2对引物,其序列为:
引物组合1:
上游引物PXB101:5′-TTGATTACGTCCCTGCCCTTT-3′
下游引物AB28:5′-ATATGCTTAAGTTCAGCGGGT-3′
引物组合2:
上游引物F194:5′-CGTAACAAGGTAGCTGTAG-3′
下游引物AB28:5′-ATATGCTTAAGTTCAGCGGGT-3′。
2.根据权利要求1所述的引物组合的使用方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一、线虫DNA的提取:
首先用双蒸水将线虫清洗干净,然后挑取单条线虫放入含8μL ddH2O的PCR管中,再反复冻融2次后,加入2μL裂解液,最后56℃保温1h,95℃加热10min即可。经所述步骤提取获得的上清液可用于后续的分子实验;所述冻融为液氮处理1min,65℃水浴2min;所述裂解液为10×PCR Buffer、双蒸水与20mg/mL蛋白酶K的混合液,三者的体积比为10∶9∶1;
步骤二、核糖体ITS区的PCR扩增:
PCR扩增体系(25μL):10×PCR Buffer(Mg2+)2.5μL,dNTP(2.5mmol/L)1μL,上游引物(10μmol/L)0.5μL,下游引物(10μmol/L)0.5μL,rTaq DNA聚合酶(5U/μL)0.2μL,模板DNA5μL,双蒸水15.3μL;PCR反应条件:94℃预变性3min;40个循环反应:94℃变性40sec,55℃退火40sec,72℃延伸1.5min;最后72℃保温5min,使反应物充分延伸;
步骤三、PCR产物的电泳检测:
每个样品取3μL扩增产物,使用2%的琼脂糖凝胶进行电泳,设置电压160V,电泳30min后将凝胶放入EB染液中染色15min,随后置于凝胶成像系统中观察并拍照。
3.根据权利要求2所述的使用方法,其特征在于:步骤二中PCR反应条件要求退火温度为55℃。
4.根据权利要求2所述的使用方法,其特征在于:所述线虫为穿刺短体线虫(Pratylenchus penetrans)、玻利维亚短体线虫(Pratylenchus bolivianus)、斯氏短体线虫(Pratylenchus scribneri)、朱顶红短体线虫(Pratylenchus hippeastri)、松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)、拟松材线虫(B.mucronatus)、豆伞滑刃线虫(Bursaphelenchus doui)、阿苏里伞滑刃线虫(Bursaphelenchus arthui)或水稻干尖线虫(Aphelenchoides besseyi)。
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