[发明专利]一种基于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的方法有效
申请号: | 201410270207.0 | 申请日: | 2014-06-17 |
公开(公告)号: | CN104004852A | 公开(公告)日: | 2014-08-27 |
发明(设计)人: | 戴鹏高;寻晓洁;陈超;邹晖 | 申请(专利权)人: | 陕西佰美基因股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 西安智邦专利商标代理有限公司 61211 | 代理人: | 胡乐 |
地址: | 710075 陕西省*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 荧光 定量 pcr 检测 cyp2a6 基因 缺失 方法 | ||
1.一种基于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的方法,用于非疾病诊断目的,包括以下环节:
(1)基因特异性引物的设计:
针对CYP2A6基因设计的序列特异性引物探针组合,序列如下:
上游引物:5’-TCCCACCCTACTCCCTCTCTC-3’
下游引物:5’-GGAGGTGAACGCGGGA-3’
探针:5’-FAM-TGGAGACAGGCCAGGGGGCG-BHQ2-3’
针对ALB基因设计的序列特异性引物探针组合,序列如下:
上游引物:5’-TGTTGCATGAGAAAACGCCA-3’
下游引物:5’-GTCGCCTGTTCACCAAGGAT-3’
探针:5’-HEX-AGTGACAGAGTCACCAAATGCTGCACA-BHQ2-3’
其中,FAM为6-carboxyfluorescein;HEX为6-carboxy-hexachlorofluorescein;BHQ2为Black Hole Quencher-2;
(2)模板的制备:提取待测样本的基因组DNA;
(3)实时定量PCR:
以反应体系总量20μL计,在同一个反应体系中,加入CYP2A6基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、以及ALB基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、2×Mastermix10μL、待测样本的基因组DNA10-50ng,H2O补足体积20μL;
(4)结果判定:将配制好的反应体系在荧光实时定量PCR仪上进行扩增,根据仪器给出的两基因的扩增指标进行结果判定。
2.根据权利要求1所述的基于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的方法,其特征在于,荧光实时定量PCR仪上进行的扩增过程的扩增参数为:95℃,2~15min,不循环;95℃,5~10sec,60℃,20-30sec,68℃,20~30sec,共计35~40个循环。
3.一种用于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1中所述的针对CYP2A6基因设计的序列特异性引物探针组合、针对ALB基因设计的序列特异性引物探针组合、以及2×Mastermix和H2O。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:以试剂盒中的试剂总量20μL计,CYP2A6基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、以及ALB基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、2×Mastermix10μL,H2O补足体积20μL。
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