[发明专利]一种基于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的方法有效

专利信息
申请号: 201410270207.0 申请日: 2014-06-17
公开(公告)号: CN104004852A 公开(公告)日: 2014-08-27
发明(设计)人: 戴鹏高;寻晓洁;陈超;邹晖 申请(专利权)人: 陕西佰美基因股份有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 西安智邦专利商标代理有限公司 61211 代理人: 胡乐
地址: 710075 陕西省*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 荧光 定量 pcr 检测 cyp2a6 基因 缺失 方法
【权利要求书】:

1.一种基于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的方法,用于非疾病诊断目的,包括以下环节:

(1)基因特异性引物的设计:

针对CYP2A6基因设计的序列特异性引物探针组合,序列如下:

上游引物:5’-TCCCACCCTACTCCCTCTCTC-3’

下游引物:5’-GGAGGTGAACGCGGGA-3’

探针:5’-FAM-TGGAGACAGGCCAGGGGGCG-BHQ2-3’

针对ALB基因设计的序列特异性引物探针组合,序列如下:

上游引物:5’-TGTTGCATGAGAAAACGCCA-3’

下游引物:5’-GTCGCCTGTTCACCAAGGAT-3’

探针:5’-HEX-AGTGACAGAGTCACCAAATGCTGCACA-BHQ2-3’

其中,FAM为6-carboxyfluorescein;HEX为6-carboxy-hexachlorofluorescein;BHQ2为Black Hole Quencher-2;

(2)模板的制备:提取待测样本的基因组DNA;

(3)实时定量PCR:

以反应体系总量20μL计,在同一个反应体系中,加入CYP2A6基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、以及ALB基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、2×Mastermix10μL、待测样本的基因组DNA10-50ng,H2O补足体积20μL;

(4)结果判定:将配制好的反应体系在荧光实时定量PCR仪上进行扩增,根据仪器给出的两基因的扩增指标进行结果判定。

2.根据权利要求1所述的基于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的方法,其特征在于,荧光实时定量PCR仪上进行的扩增过程的扩增参数为:95℃,2~15min,不循环;95℃,5~10sec,60℃,20-30sec,68℃,20~30sec,共计35~40个循环。

3.一种用于荧光定量PCR检测CYP2A6全基因缺失的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1中所述的针对CYP2A6基因设计的序列特异性引物探针组合、针对ALB基因设计的序列特异性引物探针组合、以及2×Mastermix和H2O。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:以试剂盒中的试剂总量20μL计,CYP2A6基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、以及ALB基因特异性上游引物250nM-500nM、下游引物250nM-500nM、探针100nM-200nM、2×Mastermix10μL,H2O补足体积20μL。

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