[发明专利]检测奶牛子宫内膜细胞炎性反应的荧光定量PCR试剂盒及其检测方法和应用有效
申请号: | 201410270225.9 | 申请日: | 2014-06-18 |
公开(公告)号: | CN104017882A | 公开(公告)日: | 2014-09-03 |
发明(设计)人: | 张世栋;王东升;董书伟;严作廷;王旭荣;杨峰 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京中恒高博知识产权代理有限公司 11249 | 代理人: | 高松 |
地址: | 730000 甘肃省*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 奶牛 子宫 内膜 细胞 反应 荧光 定量 pcr 试剂盒 及其 方法 应用 | ||
技术领域
本发明属于PCR扩增技术领域,具体涉及检测奶牛子宫内膜细胞炎性反应的特异性荧光定量PCR试剂盒和检测方法。
背景技术
聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是DNA体外操作技术中最常用的技术,实现了靶DNA片段在反应液中呈指数倍扩增。荧光定量PCR技术结合了实时荧光检测技术和计算机分析技术,在PCR反应体系中加入特定的荧光标记物质,通过检测每个热循环后PCR反应体系中的荧光值的变化情况来实时监测DNA的扩增情况,并获得每个样本的荧光定量变化曲线,进而获得每个反应管中荧光变化达到阈值时的PCR循环数(Ct);以起始模板数的对数为横坐标,以Ct值为纵坐标制备标准曲线,据此各个标本的Ct值对每个反应的起始DNA模板数进行定量测定。
SYBR Green是一种结合于双链DNA小沟中的荧光染料。与双链DNA结合后,其荧光发光度大大增强。这种性质用于扩增产物的检测非常理想。在 PCR 反应体系中,加入过量的SYBR Green荧光染料能充分地、特异性地掺入DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的 SYBR 染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。SYBR Green在核酸的实时检测方面有很多优点,由于它与所有的双链DNA相结合,不必因为模板不同而特别定制,因此设计的程序通用性好,且价格相对较低。此外,由于一个PCR产物可以与多分子的染料结合,因此SRYB Green的灵敏度很高。但是,由于SYRB Green与所有的双链DNA相结合,因此由引物二聚体、单链二级结构以及错误的扩增产物引起的假阳性会影响定量的精确性。通过测量升高温度后荧光的变化可以帮助降低非特异产物的影响。通过熔解曲线来分析产物的均一性有助于分析由SYBR Green得到定量结果的准确性。
奶牛隐性子宫内膜炎是产后恢复后普遍存在的一种产科疾病,由于无明显的临床症状,有关奶牛隐性子宫内膜炎的体外诊断也较为困难,该病往往对养殖经济造成巨大损失。
发明内容
本发明提供了一种体外分离的检测奶牛子宫内膜细胞炎性反应的荧光定量PCR试剂盒,利用该试剂盒进行的体外检测的结果可以为判断奶牛是否患有隐性子宫内膜炎提供较好的参考价值。为此,本发明还提供其检测方法和应用。
奶牛隐性子宫内膜炎是子宫上皮细胞的慢性炎症过程,而我们的研究结果表明,奶牛子宫内膜上皮细胞中淀粉样蛋白(SAA)基因的表达水平升高与子宫内膜炎直接相关。因此,本发明提供一种操作简便、快速,且能够以相对定量检测不同奶牛子宫内膜细胞中淀粉样蛋白基因(SAA)的相对转录水平(与ACTB相比较所得比值)的试剂盒,从而判断奶牛是否患有隐性子宫内膜炎。ACTB基因是一种看家基因,在细胞内表达稳定,是理想的内参基因。
本发明提供一种牛子宫内膜细胞炎性反应检测的荧光定量PCR试剂盒,包括含SYBR Green染料的PCR 反应液、Taq DNA 聚合酶混合物和两对引物,所述引物序列如下:
引物1(SAA基因):上游引物序列为5’-TATGACCAGGGACCAGGTAC-3’,下游引物序列为5’- CTCTGCCCTTAGGGACTCACAG -3’;
引物2(ACTB基因):上游引物序列为5’-ATCGGCAATGAGCGGTTCC-3’,下游引物序列为5’- GTGTTGGCGTAGAGGTCCTTG -3’。
其中,所述牛为奶牛。
本发明的第二个目的是提供一种奶牛子宫内膜细胞炎性反应的相对定量检测方法,是以奶牛子宫内膜细胞中总mRNA反转录的cDNA为模板,利用引物1、2和SYBR Green染料进行实时荧光定量PCR,根据扩增曲线判定结果:当引物1扩增的基因表达量相对于引物2扩增的基因表达量>5倍,则判断为奶牛隐性子宫内膜炎为阳性;反之则为阴性。
优选地,所述实时荧光定量PCR的反应条件为:95℃预变性2min;PCR反应39个循环,其循环过程为95℃变性20s,60.5℃退火30s,72℃延伸30s,每个循环后检测荧光信号值。
本发明还提供上述试剂盒在离体奶牛子宫内膜细胞炎性反应检测和鉴定奶牛隐性子宫内膜炎中的应用。
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