[发明专利]利用SSR分子标记鉴定杏品种的方法有效
申请号: | 201410272735.X | 申请日: | 2014-06-18 |
公开(公告)号: | CN104099414B | 公开(公告)日: | 2018-12-11 |
发明(设计)人: | 王玉柱;张俊环;姜凤超;孙浩元;杨丽 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院林业果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100093 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 ssr 分子 标记 鉴定 品种 方法 | ||
1.用于鉴定杏品种的引物组合,其特征在于,所述引物组合包括用于PCR扩增杏品种SSR分子标记PSSR1、PSSR2和PSSR3的引物对;
其中,用于PCR扩增分子标记PSSR1的引物对分别为:
上游引物PSSR1F:5'-CAGAGTGCCCTCAGAGATTTG-3'和
下游引物PSSR1R:5'-TCCGTCGTCTTCACTGATTT-3'
用于PCR扩增分子标记PSSR2的引物对为:
上游引物PSSR2F:5'-CATGAACAGGGTCAAAAGCA-3'和
下游引物PSSR2R:5'-TATATCCTTACGCGGCCTCA-3'
用于PCR扩增分子标记PSSR3的引物对为:
上游引物PSSR3F:5'-CTGCTCTCACTCAACTCAATGC-3'和
下游引物PSSR3R:5'-CTCCCCTACCCCTCTGTATCTC-3'。
2.权利要求1所述引物组合在杏品种鉴定、植物材料遗传多样性分析、指纹图谱构建及分子标记辅助育种中的应用。
3.一种利用SSR分子标记组合鉴定杏品种的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测植物的基因组DNA;
2)以待测植物的基因组DNA为模板,分别利用用于PCR扩增杏品种SSR分子标记PSSR1、PSSR2和PSSR3的引物对进行PCR扩增;
3)检测PCR扩增产物;
其中,步骤2)中所述引物对的定义同权利要求1中所述。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤2)中PCR反应体系按20μL计为:10μmol/L上、下游引物各0.4μL,5U/μL Taq DNA聚合酶0.2μL,10mmol/L dNTPs 0.4μL,25mmol/L Mg2+1.6μL,40ng/μL模板3μL,10×PCR反应缓冲液2μL,用ddH2O补足至20μL。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤2)中PCR扩增程序为:94℃预变性3min;94℃变性45s,55~58℃退火30s,72℃延伸45s,共35个循环;最后72℃延伸8min,保存于15℃。
6.含有权利要求1所述引物组合的用于鉴定杏品种的试剂盒。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液及标准阳性模板中的至少一种。
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